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  • ‘NSBS’ for signature 'SortedByQueryHits'

    兩種原因,ChIPseeker會出現(xiàn)如下報錯 ‘unable to find an inherited method for function...

  • 植物測序數(shù)據(jù)rRNA污染清理

    由于實驗技術(shù)或操作原因,有些高通量測序數(shù)據(jù)中存在大量的rRNA污染,評估和去除rRNA是后續(xù)分析的基礎(chǔ)。 首先 到核糖體RNA數(shù)據(jù)庫 silva...

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    從零開始學習circos(一)

    circos是基因組學最經(jīng)常使用的圖之一,軟件按照調(diào)試已經(jīng)完成了,相對簡單。circos最繁盛的地方是學習conf文件配置,下面從零開始記錄ci...

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    maSigPro 處理時間序列轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)

    時間序列研究的是基因表達的動態(tài)行為,測量的是一系列和時間點之間有強烈相關(guān)性的過程。和針對某一時間點的基因表達進行差異分析不同,時間序列更加關(guān)注是...

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  • MethylKit 使用手冊

    methylKit是一個用于分析DNA甲基化測序數(shù)據(jù)的R包,其核心功能是差異甲基化分析和差異甲基化位點/區(qū)域的注釋。 1. 加載原始數(shù)據(jù) DNA...

  • 使用ImpluseDE2處理轉(zhuǎn)錄組時間序列數(shù)據(jù)

    ImpulseDE2 是一個處理時序數(shù)據(jù)的R包,用于查找時序數(shù)據(jù)的差異基因,它可以用來解決兩類問題。 Case-only differentia...

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    WGCNA 挑選軟閾值

    我們今天就搞清楚這兩個問題:1.什么是無尺度分布2.手工計算軟閾值 無尺度分布 假如我問大家,如果你想認識世界上的任何一個人,需要通過幾個人來聯(lián)...

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    在NCBI建立BioProject及數(shù)據(jù)上傳

    1、創(chuàng)建自己的NCBI賬號 過程,略 2、創(chuàng)建BioProject 1、進入BioProject 2、選擇Submission 3、創(chuàng)建new ...

  • numpy安裝成功后 依然顯示 no module named numpy

    今天在運行某個軟件時,提示numpy版本過低,于是用之前的方法安裝了新的numpy 結(jié)果出現(xiàn)標題的報錯 檢測后發(fā)現(xiàn)是conda將numpy裝在了...

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