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  • 互幫互助問(wèn)答帖

    雖然沒(méi)有幾個(gè)關(guān)注,但能看到這些筆記的應(yīng)該都是同志們 有時(shí)候朋友的私信我可能看不到,我也不一定能解決。 群體遺傳學(xué)方面、生信方面、R語(yǔ)言等等,如果...

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  • CLUES 推斷位點(diǎn)的受選擇時(shí)間

    CLUES(Conditional Likelihood Under Evolutionary Scenarios)是一個(gè)用于推斷單個(gè)位點(diǎn)在群體...

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    Relate 估計(jì)位點(diǎn)的起源時(shí)間

    1、轉(zhuǎn)換文件格式 從 VCF 文件轉(zhuǎn)換為 relate 軟件可以讀取的 hap 格式: PATH_TO_RELATE/bin/RelateFil...

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  • VCF 文件格式轉(zhuǎn)換

    推薦一個(gè) VCF 文件格式轉(zhuǎn)換的腳本。 https://github.com/edgardomortiz/vcf2phylip 常見(jiàn)用法:將 V...

  • LDBlockShow 計(jì)算連鎖不平衡(LD)熱圖

    安裝: wget https://github.com/hewm2008/LDBlockShow/archive/v1.40.tar.gztar...

  • 基于兩個(gè) fasta 序列獲得 vcf 文件

    1. 基于 BWA 進(jìn)行序列比對(duì) bwa index reference.fastabwa mem reference.fasta sample...

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    Bayenv 是一種基于環(huán)境相關(guān)性識(shí)別與局部適應(yīng)相關(guān)位點(diǎn)的軟件,主要用于檢測(cè)那些在局部適應(yīng)過(guò)程中可能發(fā)揮重要作用的遺傳標(biāo)記(如 SNP)。 和環(huán)...

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    PGDSpider 進(jìn)行格式轉(zhuǎn)換

    下載安裝: wget https://software.bioinformatics.unibe.ch/pgdspider/PGDSpider_...

  • tar 打包和壓縮文件

    tar是 Linux/Unix 中的一個(gè)常用工具,用于創(chuàng)建和提取歸檔文件。tar的全稱(chēng)是 “tape archive”,它原本設(shè)計(jì)用于將文件存儲(chǔ)...

個(gè)人介紹
張紅祥,中國(guó)科學(xué)院植物研究所。
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