發簡信
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0701coming最近在看網絡藥理學相關的內容推薦一個好用的網站，根據蛋白質uniprot轉換為基因名（無需代碼）https://www.uniprot.org/uploadlists/網站名...
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全基因組甲基化分析簡述DNA甲基化是一種非常基礎且重要的表觀修飾，在調控基因表達、轉錄因子結合和抑制轉座子元件中起到關鍵的作用。 目前，DNA甲基化檢測的技術已經比較成熟，例如高通量的WGBS、R...
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GSEA相關筆記整理網頁上關于GSEA富集分析的教程很多，對自己這個生信小白來說比較簡單通俗易懂的當數生信寶典和生信技能樹的教程了。感謝大佬們的付出。下面是自己整理的個人學習筆記，可能有理解不對...
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【單細胞轉錄組1】GSVA分析小鼠的單細胞轉錄組數據目的：用GSVA分析單細胞轉錄組數據 基因集變異分析（GSVA）是一種非參數，無監督的方法，用于通過表達數據集的樣本估算基因集富集的差異，即基于通路上的差異分析 一、GSVA...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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cellranger
系統配置要求： Linux至少8核（推薦16核） 64GB RAM(推薦128GB)，最低配的64G允許cellranger aggr合并最多250k個細胞 1T硬盤 64-...
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CellRanger走起(三) 使用初探劉小澤寫于19.5.6 首先對上次改好名稱的fastq數據進行質控 然后利用Filezilla下載其中SRR7722937的R1、R2的html，打開看下 首先是R1的，這個...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負了努力
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CellRanger走起(四) Cell Ranger流程概覽劉小澤寫于19.5.7主要看流程，這一篇不涉及真實數據展示 總的來說，Cell Ranger主要的流程有：拆分數據 mkfastq、細胞定量 count、定量組合 aggr、...
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CellRanger走起(一)數據下載劉小澤寫于19.5.3 數據來自2018年9月的NC文章Acquired cancer resistance to combination immunotherapy fro...
