軟件 1.JCVI2.NGenomeSyn3.synvisio在線工具：鏈接 https://synvisio.github.io/[https://synvisio.git...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：安徽
-
「基因組」基因共線性可視化（待更新） -
genblastg和genewise鑒定缺失基因
基于組裝好的基因組，例如某一個(gè)基因在該基因組中無(wú)注釋?zhuān)铏z查是否為注釋錯(cuò)誤，還是該基因本身缺失。 軟件：genblastg和genewise genblastg下載地址：ht...
-
接上，pcoc檢測(cè)氨基酸性質(zhì)的趨同
pcoc檢測(cè) step1. 處理樹(shù)文件；將第2步生成的02_Trees文件夾拷貝到當(dāng)前目錄，并修改為.txt結(jié)尾 step2：處理序列文件 step3: 準(zhǔn)備需要檢測(cè)物種的文...
-
僅作個(gè)人筆記 - 基于fithic的輸出結(jié)果統(tǒng)計(jì)染色體體間顯著互作的密度-1.更新于2025.4借助于GPT，這個(gè)功能一下子就可以實(shí)現(xiàn)，下面展示GPT的成果輸出文件可以直接用pheatmap畫(huà)圖 cat interact_density_to_m...
-
-
WGDI - 推斷祖先核型0.僅作個(gè)人筆記使用意思就是只考慮我能不能看懂具體每個(gè)參數(shù)的含義參照官方文檔, 這里全部用默認(rèn)參數(shù)https://wgdi.readthedocs.io/en/latest/...
-
ChromoSSE: 染色體數(shù)目進(jìn)化/Chromosome Number Evolutionhttps://github.com/wf8/ChromoSSE[https://github.com/wf8/ChromoSSE] 1.輸入文件的準(zhǔn)備.兩個(gè)文件, 一個(gè)是進(jìn)...
-
2023-09-21 PSMC可以評(píng)估有效群體大小的原因
介紹這個(gè)軟件的概念前，我需要先解釋一個(gè)概念最近共同祖先時(shí)間（the time since the most recent common ancestor，TMRCA）。當(dāng)我們...
-
隨筆 | 十年之后，我們?nèi)匀粵](méi)能坐在一起喝上一口啤酒時(shí)間過(guò)得很快，或許可以說(shuō)，從7月底到現(xiàn)在，我仍然沒(méi)有忙完手頭的事情。上午收到消息時(shí)，我仍然在趕著項(xiàng)目，有時(shí)候，不知道是對(duì)是錯(cuò)。多算一年半年，與基友「醬油」認(rèn)識(shí)可能也是10年。...
個(gè)人介紹