之前使用gblocks裁剪比對序列，感覺裁剪的不是很智能，大量可能有用的序列被裁剪掉，所以嘗試使用trimal。 1.下載安裝 在自己目錄下輸入 導入trimal安裝包（如果...
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輪狀病毒進化分析-Rotavirus步驟一：數據清洗 將ID重復的進行篩除，經過初步計算進化速率為0.9E-3，將同年序列差異<=3的進行隨機篩選，保留一個。最后得到147條VP7序列。我為啥做這一步，我在N多...
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關于NCBI-SRA數據不再提供質量值的解決方案近期在NCBI SRA中下載的FastQ數據不再提供質量值信息（圖1和圖2），據說是為了后期便于斂財收費提供質量值，鄙人對這種萬惡的資本主義行徑大為不齒，NCBI這是自絕于世...
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應用Aspera高速下載NCBI和EBI數據
1 下載和安裝 Aspera 下載：需要到IBM官網[https://www.ibm.com/products/aspera/downloads]下載，點擊選擇Client ...
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容器啟動異常 devicemapper: Error running deviceCreate (CreateSnapDeviceRaw) dm_task_run failed
異常:Cannot create container for service xmq: devicemapper: Error running deviceCreate (C...
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基因結構注釋（2）：同源注釋同源預測(homology prediction)利用近緣物種已知基因進行序列比對，找到同源序列。然后在同源序列的基礎上，根據基因信號如剪切信號、基因起始和終止密碼子對基因結...
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R包安裝報錯：nzchar(SHLIB_LIBADD)
Error in if (nzchar(SHLIB_LIBADD)) SHLIB_LIBADD else character() : argument is of lengt...
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GenomeScope 2.0 評估基因組大小、雜合度和重復序列GenomeScope 是2017年發表在 bioinformatic 的一個工具，這個工具的目的就是處理一些高復雜度的基因組，比如說高雜合度或者基因組非常大的物種。Geno...
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