發簡信
IP屬地：北京
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軟件17 —— DiffBind
一、 基本介紹 DiffBind是鑒定兩個樣本間差異結合位點的一個R包。主要用于peak數據集，包括對peaks的重疊和合并的處理，計算pea...
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軟件16 —— ChIPseeker
一、 基本介紹 ChIPseeker可以用來對ChIP-seq數據進行注釋與可視化。 二、 使用方法 (1) 安裝并載入R包 (2) bed...
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軟件15 —— exomePeak2
一、 基本介紹 exomePeak2使用bam文件進行peak calling以及peak統計，它整合了meRIP-seq數據分析的常規分析內...
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軟件14 —— IGV一、 基本介紹 IGV（Integrative Genomics Viewer）是一款本地即可使用的基因組瀏覽器。支持BAM、SAM、GOBY...
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軟件13 —— rMATS一、 基本介紹 rMATS是一款對RNA-Seq數據進行差異可變剪切分析的軟件。其通過rMATS統計模型對不同樣本（有生物學重復的）進行可變剪...
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軟件12 —— bcftools一、 基本介紹 VCF格式（Variant Call Format）是存儲變異位點的標準格式，用于記錄variants（SNP / InDel...
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軟件11 —— deeptools一、 基本介紹 deeptools是基于Python開發的一套工具，用于處理諸如RNA-seq、ChIP-seq、MNase-seq、ATAC...
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軟件10 —— HOMER和bedtools一、 基本介紹 HOMER（Hypergeometric Optimization of Motif EnRichment），用于Motif的...
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軟件9 —— MACS2
一、 基本介紹 ※ 峰識別（peak calling）工具包括：MACS2和HOMER（適用于ChIP-seq和ATAC-seq）、HMMRA...