關于單細胞轉錄組轉錄因子的分析我們之前在單細胞系列講過R語言版本的，參考：跟著Cell學單細胞轉錄組分析(十二):轉錄組因子分析[http://mp.weixin.qq.co...
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PySCENIC（一）：python版單細胞轉錄組轉錄因子分析
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R語言|Cox模型校準度曲線繪制轉自個人微信公粽號【易學統計】的統計學習筆記：R語言實現Cox模型校準度曲線繪制[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4MjgyODQzN...
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單細胞交響樂17-不同單細胞R包的數據格式相互轉換劉小澤寫于2020.7.18為何取名叫“交響樂”？因為單細胞分析就像一個大樂團，需要各個流程的協同配合單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment單...
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單細胞之富集分析-2：批量GSEA和GSVA分析單細胞富集分析系列： 單細胞之富集分析-1：單細胞GSEA分析流程[http://www.lxweimin.com/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...
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67-R中dataframe與list的轉換
內容概覽 1、dataframe轉換為list-- 1.1. 每一列作為list的一個元素-- 1.2. 每一行作為list的一個元素-- 1.3. 對行進行分組，每一組作為...
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安裝ComplexHeatmap報錯，cairo安裝問題ComplexHeatmap安裝了之后，加載一直報錯，報錯信息如下： 看樣子是Cairo 沒有加載上嘗試安裝加載 安裝正常，還是加載報錯 首先百度各種消息唯一可能有效的是簡書...
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纖維化機制：Myofibroblast的來源和功能1. 簡介 纖維化是由肌成纖維細胞在慢性炎癥反應中過度沉積細胞外基質（ECM）蛋白引起的疤痕和組織硬化。多種有害刺激（包括毒素、傳染性病原體、自身免疫反應和機械應激）能夠誘導...
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TCGA文章復現——LncRNA-CRC預后Title:An Integrated Three-Long Non-coding RNA Signature Predicts Prognosis in Colorecta...
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TCGA數據的一致性聚類實戰和可視化通過不同的聚類算法，依據不同的基因或指標給樣本聚類，是數據挖掘文章里面經常出現的操作咯。接下來要寫寫不同聚類方法的介紹和代碼實現啦。 1.輸入數據 目前從網上找到的代碼大多是...
