發簡信
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2020-04-11
博客主頁： 目前簡書已經不再更新，有興趣的同學可以關注個人博客主頁：https://chenhongyubio.github.io/
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基因家族分析全套軟件
基因家族生物信息學分析 （1）基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通過基因復制進行物種特異性擴增，主要有染色體片段復制、串聯復制和反轉錄子...
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玫瑰圖繪制
雷達圖繪制 （1）ggplot2簡約版雷達圖 library(ggplot2) dt = data.frame(A2 = c(0, 3.33, ...
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單細胞轉錄組擴增技術
單細胞轉錄組測序方法詳解 1 Smart-seq2（擴增全長轉錄組） 通過ployT抓取，只能檢測mRNA。 Smart-seq2步驟: 1通過...
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edgeR
edgeR 主要是利用了多組實驗的精確統計模型或者適用于多因素復雜實驗的廣義線性模型。 前者叫做“經典edgeR”， 后者叫做”廣義線性模型 e...
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WGCNA代碼
WGCNA rm(list = ls()) #加載R包 library(WGCNA) library(tidyr) library(ggplot...
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HMMER3.1軟件使用
HMMER3.1軟件的使用 HMMER3.1官方下載地址：http://hmmer.org/download.html。 HMMER3.1使用手...
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轉錄組數據標準化--Normalization轉錄組數據經過比對到參考基因組獲得對應基因count值后，因為測序深度以及基因長度的關系，在進行差異分析之前，還需要進行標準化。標準化是轉錄組數...
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Augustus
在基因組注釋中，預測基因結構是最核心的一環，在眾多的從頭預測軟件中，augustus應用較廣。但是由于安裝過程依賴軟件較多，如果沒有管理員權限一...