前言：眾所周知，NCBI對我朝的局域網不甚友好，對于國內的生信玩家來說，想要下載SRA數據庫的.sra或者.fastq經常遇到網速問題，慢到你懷疑人生有木有！因此，我在這里摸...
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如何構建表達矩陣——RNAseq中游分析
中游分析這個詞是我杜撰的，用來強調表達矩陣構建過程并不簡單。 0 前言 前幾天Jimmy老師發了一篇 我用這個技能一杯咖啡的功夫就掙了800塊錢，講了他幫一個粉絲從公共數據庫...
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ChIP-seq實踐(H3K27Ac,enhancer的篩選和enhancer相關基因的GO分析)在實踐之前，我先查找了一下有關組蛋白修飾的知識點：（參考文章：http://www.lxweimin.com/p/8aca72809c5c） 組蛋白修飾能預測染色質的類型（異...
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2019意猶未盡的基因組可視化IGV（一）劉小澤寫于19.6.8之前最開始學習IGV的時候寫過兩篇推文，當時簡單做了了解，但有朋友說意猶未盡，嗯我也這么覺得，總覺得還是學的不夠。推薦閱讀：https://github...
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Miniconda的安裝與使用（以轉錄組分析軟件為例）
在Ubuntu 16系統執行 1.安裝miniconda wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-lates...
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下載參考基因組后進行完整性檢驗、建立索引
摘錄自：https://blog.51cto.com/xiangpang/1711603 http://www.lxweimin.com/p/9b15fa1f1...
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bwa bowtie2 salmon subread hisat2建索引和比對bwa bowtie salmon 直接從fastq到達特異性表達矩陣 subread 備注：需要對應建索引的軟件版本，版本不同會報錯！ hisat2 HISAT2建立索引時...
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win10下的ubuntu的子系統安裝docker剛開始走了彎路，按照網絡上的教程一步步安裝docker 這時一直出現這個錯誤Cannot connect to the Docker daemon at unix:///va...
