我們生活著的世界并非只有我們自己，而是有很多小于或大于我們的生物不斷與我們交互著，有的讓我們開(kāi)心，有的使我們傷心。這就關(guān)系到一個(gè)本質(zhì)的問(wèn)題： 我是誰(shuí)？ 我是一個(gè)腦袋，一個(gè)軀體...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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10× Genomics單細(xì)胞免疫組庫(kù)VDJ分析必知必會(huì) -
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這個(gè)世界流行離開(kāi)，但我們卻不擅長(zhǎng)告別
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北京基因組所研究生<br><br>Focus on Bioinformatics and Machine-Learning<br><br>Follow me on Github: <a href="https://github.com/Ming-Lian" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/Ming-Lian</a><br><br>跳出局部最優(yōu)，搜索全局最優(yōu)
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪(fǎng)問(wèn))
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miRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預(yù)測(cè)新miRNA，到表達(dá)矩陣【二】該教程分為2部分，第1部分在：miRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預(yù)測(cè)新miRNA，到表達(dá)矩陣【一】 到此時(shí)，原始...
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一些生物信息學(xué)用到的軟件，工具，介紹用法安裝以及以及應(yīng)用的文章 ?? 測(cè)序組裝使用的Spades、canu等等 ?? 序列比對(duì)比如blast、bowtie、diamond等 ?? 多序列比對(duì)比如mega、clustalW、matff等 ?? 序列格式轉(zhuǎn)化的samtools、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻(xiàn)下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 ?? 尋找測(cè)序中的結(jié)構(gòu)變異或者SNP序列GATK、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o、QIMME ?? 測(cè)序質(zhì)量評(píng)估的FastQC、BUSCO、QUAST ?? 可視化工具比如IGV、3D Genome ?? 測(cè)序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
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周運(yùn)來(lái)，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹(shù)。生信技能樹(shù)核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
