我們生活著的世界并非只有我們自己，而是有很多小于或大于我們的生物不斷與我們交互著，有的讓我們開心，有的使我們傷心。這就關系到一個本質的問題： 我是誰？ 我是一個腦袋，一個軀體...
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10× Genomics單細胞免疫組庫VDJ分析必知必會 -
北京基因組所研究生<br><br>Focus on Bioinformatics and Machine-Learning<br><br>Follow me on Github: <a href="https://github.com/Ming-Lian" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/Ming-Lian</a><br><br>跳出局部最優，搜索全局最優
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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miRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預測新miRNA，到表達矩陣【二】該教程分為2部分，第1部分在：miRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預測新miRNA，到表達矩陣【一】 到此時，原始...
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一些生物信息學用到的軟件，工具，介紹用法安裝以及以及應用的文章 ?? 測序組裝使用的Spades、canu等等 ?? 序列比對比如blast、bowtie、diamond等 ?? 多序列比對比如mega、clustalW、matff等 ?? 序列格式轉化的samtools、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS、MISO ?? 微衛星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進化樹構建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 ?? 尋找測序中的結構變異或者SNP序列GATK、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o、QIMME ?? 測序質量評估的FastQC、BUSCO、QUAST ?? 可視化工具比如IGV、3D Genome ?? 測序數據下載工具SRA Toolkit、ascp等 ?? 數據可視化的工具circos 等等
