加載所需R包 設置工作路徑 構建測試數據集 將熱圖結果按聚類后的順序輸出
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snakemake使用筆記
snakemake是一個用來編寫任務流程的工具，用python編寫的，因此其執行的流程腳本也比較通俗易懂，易于理解。 一、從一個簡單的例子開始 1、安裝snakemake 安...
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【Bioconductor系列】如何用Bioconductor對基因組注釋
這一次，我們來聊聊基因組注釋。首先問自己一個問題，為什么要進行基因注釋。就我目前而言，它用來解決如下問題： 在mapping-by-sequencing的時候，我找到了一些可...
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使用R語言進行卡方檢驗（chi-square test）文|程瑞林（山東大學第二醫院足踝外科）來源|（微信公眾號）云中瑞麟（ID：ruilinfly） 瑞麟導讀：對于計量資料，臨床醫學研究中常用的統計分析方法是t檢驗；而對于計數資...
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繪制差異基因kegg注釋圖
“差異基因kegg注釋圖”是轉錄組分析結果的重要組成部分，能夠幫助大家了解差異基因分屬于哪些代謝通路，文章中如果能夠插入下面這類圖來說明樣品間的差異，一定會為你的文章增色不少...
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GTF/GFF文件的差異及其相互轉換我們在做生物分析的時候，經常會碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注釋文件。他們有著相似的名字，甚至連內容都極為相似~那么，他們究竟差在哪里呢？ GFF全稱為general ...
