常見(jiàn)的堆砌條形圖看膩了，試試沖積條形吧！！ 參考： 數(shù)據(jù)鏈接： 提取碼: ejrr
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求個(gè)原數(shù)據(jù)
[R構(gòu)建函數(shù)基礎(chǔ)篇] 計(jì)算多樣性指數(shù)及繪圖
本節(jié)來(lái)介紹如何R來(lái)自定義構(gòu)建函數(shù)來(lái)進(jìn)行多樣性指數(shù)計(jì)算及繪圖 加載R包 導(dǎo)入數(shù)據(jù) 定義函數(shù)計(jì)算多樣性指數(shù) 導(dǎo)出指數(shù)計(jì)算結(jié)果 整理繪圖文件 在此選取我們需要的數(shù)據(jù)來(lái)進(jìn)行展示 定義...
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三元圖 - ggternggtern ，用于創(chuàng)建三元圖的ggplot2的擴(kuò)展包，詳細(xì)參數(shù)和用法見(jiàn) 官方說(shuō)明文檔 。 三元圖是可以繪制三種不同元素或化合物的混合成分的特征圖，由于第3維是線性的并且僅依...
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R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)Alpha多樣性指數(shù)的計(jì)算
R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)Alpha多樣性指數(shù)的計(jì)算 上次我們已經(jīng)使用R語(yǔ)言來(lái)對(duì)OTU表的抽平分析，那么我們?nèi)绾问褂贸槠胶蟮腛TU表來(lái)重新計(jì)算Alpha多樣性呢？接下來(lái)我們就來(lái)學(xué)習(xí)一下。 不...
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Alpha多樣性Pielou均勻度指數(shù)
問(wèn)題：usearch計(jì)算出來(lái)的多樣性指標(biāo)中沒(méi)有eveness指標(biāo)，R里邊可以算，但覺(jué)得應(yīng)該會(huì)有現(xiàn)成的。 解決：vegan包 1 第一步輸入數(shù)據(jù)整理成矩陣 data = rea...
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微生物多樣性研究10步走（第一步）-OTU聚類(lèi)與注釋家好，從今天起密碼子將開(kāi)設(shè)一個(gè)新的連載模塊--微生物多樣性研究10步走，內(nèi)容包括在進(jìn)行微生物多樣性研究的過(guò)程中涉及到的知識(shí)點(diǎn)和常見(jiàn)的分析方法辨析。希望本連載能給初入研究的小白...
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R語(yǔ)言與統(tǒng)計(jì)分析專(zhuān)題，注重R語(yǔ)言編程與統(tǒng)計(jì)分析的交互式學(xué)習(xí)和思考
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— 相關(guān)系數(shù)圖一、ggplot 相關(guān)系數(shù)圖 前言 相關(guān)系數(shù)圖是對(duì)相關(guān)系數(shù)矩陣進(jìn)行可視化的，用于展示多組變量之間的相關(guān)性。 根據(jù)數(shù)據(jù)的分布特征，可以應(yīng)用不同的相關(guān)系數(shù)計(jì)算方法，如 pears...
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ggcorrplot相關(guān)系數(shù)可視化-R語(yǔ)言使用參考：https://rpkgs.datanovia.com/ggcorrplot/[https://rpkgs.datanovia.com/ggcorrplot/]我只...
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R語(yǔ)言ggplot2做云雨圖的簡(jiǎn)單小例子云雨圖的樣子如下 是一半的小提琴圖加散點(diǎn)圖的組合，看起來(lái)有些像云朵加雨滴的形式，所以得名云雨圖，主要的作用還是用來(lái)展示數(shù)據(jù)的分布情況 之前看到過(guò)相關(guān)推文進(jìn)行介紹，大部分的推文...
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有新意：會(huì)下雨的小提琴圖一、介紹 所謂的云雨圖，基本形狀由云朵和雨點(diǎn)組成，上面云朵是數(shù)據(jù)密度圖，傘就是平鋪的箱線圖，雨就是下面的數(shù)據(jù)點(diǎn)。百聞不如一見(jiàn)，快隨我一起來(lái)瞅瞅如何繪制吧。 二、R 語(yǔ)言實(shí)現(xiàn) ...
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R語(yǔ)言做生信，包括數(shù)據(jù)可視化、數(shù)據(jù)分析，數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換等。
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大數(shù)據(jù)挖掘，用R語(yǔ)言分析TCGA數(shù)據(jù)！
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R語(yǔ)言可視化（二十九）：聚類(lèi)樹(shù)圖繪制29. 聚類(lèi)樹(shù)圖繪制 清除當(dāng)前環(huán)境中的變量 設(shè)置工作目錄 使用dendrogram函數(shù)繪制聚類(lèi)樹(shù)圖 使用ggdendro包繪制聚類(lèi)樹(shù)圖 使用ggraph包繪制聚類(lèi)樹(shù)圖
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R數(shù)據(jù)可視化9:棒棒糖圖 Lollipop Chart棒棒糖圖，“望文生義”，就是長(zhǎng)得像棒棒糖的圖。聽(tīng)起來(lái)就很可愛(ài)是不是？今天就讓我們一起欣賞一下棒棒糖圖。 什么是棒棒糖圖 首先讓我們來(lái)看幾張棒棒糖圖。可以發(fā)現(xiàn)實(shí)際上就是一根柱子...
