更多內容請訪問個人公眾號---KS科研分享與服務--- 接上節（跟著Cell學單細胞轉錄組分析(二):單細胞轉錄組測序文件的讀入及Seurat對象構建[http://mp.w...
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跟著Cell學單細胞轉錄組分析(三):單細胞轉錄組數據質控（QC）及合并去除批次效應
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PPI網絡實戰:String加Cytoscape聯手挖掘PPI網絡
歡迎關注”生信修煉手冊”! 在之前的文章中，我們提到利用網絡聚類算法可以從復雜的蛋白質網絡中挖掘蛋白復合體或者相應的功能模塊，其中MCODE算法是最常用的挖掘蛋白復合體的算法...
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用cytoscape畫網絡圖經?？吹轿恼轮杏心欠N好漂亮的網絡圖，偶也想自己畫一個呢，但是不會咋整呢？ 別急，今天本椒就分享一下用cytoscape畫互作網絡圖！ 看一遍就會啦。。。還不會！那就多看幾遍哈...
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Cytoscape作蛋白互作PPI圖由于之前提到軟件版本的問題，所以以下分享是基于Cytoscape3.7.2的~ step1：導入string_interactions.tsv 文件，法1：load； 法2：...
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已經做完GO enrichment,例如david結果, ggplot2可視化有一些已經做完了GO enrichment, 得到了結果，才發現很多軟件都是直接給gene list做富集。如果已經完成分析，照樣可以畫圖，代碼如下： 原始文件示例：Anno...
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R包clusterProfiler: 轉換ID、GO/KEGG富集分析參考這篇ID轉換不用怕，clusterProfiler幫你忙這篇詳細講了無參考基因組該怎么辦，值得一看 簡單介紹一下幾種常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG開頭...
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2019-11-12 聽課筆記之蛋白質組學研究方法概述（下）轉發自http://crickcollege.com/news/169.html 寫在前面從10月底開始，由克里克學院與康昱盛主辦的蛋白質組學網絡大課堂正式開班了，整個課程由...
