PASA[http://pasa.sourceforge.net/], acronym for Program to Assemble** S**pliced Alignme...
發簡信
IP屬地：湖北
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基于PASA進行基因預測
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基因注釋：基于SNAP+Augustus+GeneMark的maker3 pipeline
我使用的maker版本為3.01.04 第一輪：將已知基因比對到基因組 包括兩個部分：??屏蔽重復序列??將已知的轉錄組/蛋白序列與基因組進行比對 1.（可選）構建自定義重復序列...
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用k-mer分析進行基因組調查：（一）基本原理（全文5058字） 【推薦】用Smudgeplot評估物種倍性后，用組合jellyfish+GenomeScope1.0做二倍體物種的基因組調查，用組合KMC+GenomeS...
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Seurat 4.0 || WNN整合scRNA和scATAC數據前情回顧 Seurat 4.0 ||單細胞數據分析工具箱有更新[http://www.lxweimin.com/p/48e4f61e3a84]Seurat 4.0 ||單細胞...
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RNA-seq(10):KEGG通路可視化:gage和pathview這部分直接從上部分RNA-seq(9):富集分析(功能注釋)[http://www.lxweimin.com/p/5d82acad6008]的數據而來，當然如果你上部分數據存...
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miRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預測新miRNA，到表達矩陣【二】該教程分為2部分，第1部分在：miRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預測新miRNA，到表達矩陣【一】 到此時，原始...
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miRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預測新miRNA，到表達矩陣【一】該教程分為2部分，第2部分在：miRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預測新miRNA，到表達矩陣【二】 因為之前碰到...
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FDR-P值是什么東西！
概念 FDR，Q value，adjust p valuep-value：衡量一次檢驗假陽性率的指標（False positive rate） ；q value：衡量錯誤發現...
