發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖北
-
Linux中利用MD5值檢測(cè)測(cè)序數(shù)據(jù)完整性
md5sum命令簡(jiǎn)介 md5sum 用于計(jì)算和校驗(yàn)文件的MD5值，md5sum命令用于生成和校驗(yàn)文件的md5值。它會(huì)逐位對(duì)文件的內(nèi)容進(jìn)行校驗(yàn)，與...
-
下載R舊版本更新R到最新版本以后，下載包各種報(bào)錯(cuò)，懷疑是版本問(wèn)題，然后下載了舊版的R,問(wèn)題得到解決。 下載地址 https://cran.r-project...
-
DNA甲基化分析④去重復(fù)＆計(jì)算胞嘧啶的甲基化值
1、去除冗余的reads 結(jié)果： 2、將bam文件轉(zhuǎn)化為sam文件 結(jié)果： 3、計(jì)算每個(gè)胞嘧啶的甲基化值 結(jié)果：
-
DNA甲基化分析③使用bismark比對(duì)
1、將參考基因組進(jìn)行重亞硫酸鹽的預(yù)處理轉(zhuǎn)換 結(jié)果： 2、將數(shù)據(jù)比對(duì)到已經(jīng)轉(zhuǎn)化了的參考基因組上 一次處理單個(gè)樣本： 一次處理多個(gè)樣本： ps:--...
-
DNA甲基化分析②數(shù)據(jù)質(zhì)控質(zhì)控原則 好的結(jié)果需要好的數(shù)據(jù)。原始下機(jī)測(cè)序數(shù)據(jù)(raw data)中，有些reads包含有測(cè)序接頭序列，這些序列不屬于測(cè)序物種中的原有序列，因...
-
DNA甲基化分析①數(shù)據(jù)及軟件準(zhǔn)備
（上接Mimiconda的安裝與配置） 1、上傳和下載數(shù)據(jù) 創(chuàng)建WGBS文件夾用來(lái)存放測(cè)序數(shù)據(jù)和參考基因組序列數(shù)據(jù) 下載參考基因組和注釋文件 G...
-
修改Linux命令提示符的顏色
bash背景下 linux命令提示符由“username@主機(jī)名+路徑”構(gòu)成，默認(rèn)的命令提示符顏色為白色，我們可以根據(jù)自己的喜好來(lái)修改命令提示符...
-
Linux新用戶登錄時(shí)出現(xiàn)“-bash-4.2$”的解決方法
Linux服務(wù)器新建立的用戶在登錄時(shí)顯示“-bash-4.2$”，而不是“user@主機(jī)名+路徑”的顯示方式。出現(xiàn)的此問(wèn)題的原因是在添加普通用戶...
-
Miniconda的安裝與配置
Miniconda的安裝與配置 1、簡(jiǎn)介 Conda 是為 Python 程序創(chuàng)建的是一種開(kāi)源的軟件包管理系統(tǒng)和環(huán)境管理系統(tǒng)，用于安裝多個(gè)版本的...