發(fā)簡信
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分子對接pymol作圖基本設(shè)置1 安裝Pymol使用Python編寫的，所以在安裝該軟件之前，要把python先安裝好。 注意，安裝過程中最好不要修改路徑，直接默認(rèn)安裝就好。...
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Vina分子對接受體和配體的對接前面已經(jīng)講完受體、配體以及對接位置的確定，下面開始正式對接的部分 1 對接文件的準(zhǔn)備，在對接文件中寫好受體、配體名稱，對接中心點(diǎn)坐標(biāo)，及距離等信...
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Vina分子對接對接位點(diǎn)的確定前面幾個(gè)內(nèi)容是指蛋白和小分子的處理過程，接下來一個(gè)非常重要的步驟是如何確定對接的位點(diǎn)，這也是整個(gè)分子對接過程中的重點(diǎn)。如果你能夠找到原結(jié)晶的配體...
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Vina分子對接小分子配體預(yù)處理前面的一節(jié)中，已經(jīng)介紹完Vina分子對接中大分子的預(yù)處理過程；這一節(jié)中主要介紹小分子的對接前的預(yù)處理的步驟。所用到的預(yù)處理軟件仍然是Autodo...
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Vina分子對接蛋白大分子預(yù)處理上面幾節(jié)，已經(jīng)講完分子對接得準(zhǔn)備階段及軟件安裝的過程，后面面對第一個(gè)問題就是蛋白大分子得預(yù)處理，下面簡單得介紹下主要的步驟。 1 在執(zhí)行vina...
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vina分子對接-環(huán)境變量設(shè)置上一節(jié)介紹到分子對接的主要的軟件安裝方法，其中vina程序是應(yīng)用命令提示符打開的，但是有些電腦卻不能正確打開，很可能是環(huán)境變量的設(shè)置問題。以下介...
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Vina分子對接相關(guān)軟件安裝方法前兩節(jié)已經(jīng)對分子對接過程中，蛋白和小分子的基本的準(zhǔn)備工作進(jìn)行了介紹。相信大家應(yīng)該很容易掌握到其中的操作內(nèi)容，一旦受體和配體分子準(zhǔn)備完畢之后，下一...
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vina分子對接 小分子配體初步準(zhǔn)備上節(jié)講到如何從PDB網(wǎng)站下載需要的蛋白，對其和原位配體進(jìn)行準(zhǔn)備之后；下一步就是準(zhǔn)備你所需要和蛋白對接的小分子化合物，該步驟方式有很多，這里介紹一...
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分子對接vina蛋白和配體準(zhǔn)備1 PDB網(wǎng)站（https://www.rcsb.org/）下載需要蛋白結(jié)構(gòu)； 2 以PDB ID 2QMJ 人體葡萄糖淀粉酶為例，查看蛋白名稱...