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miniconda的常用命令匯總
寫這個的目的主要是年紀(jì)大了，老是記不住命令行，索性整理下來，忘了就不用滿世界找了。 和channels有關(guān)的命令 查看已經(jīng)添加的channels...
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Linux下miniconda的安裝使用
Anaconda與Miniconda的區(qū)別 Anaconda是一個打包的集合器皿，里面預(yù)裝好了conda、某個版本的python、眾多packa...
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如何區(qū)分基因的顯性效應(yīng)(Dominance effect)和上位性效應(yīng)(Epistatic effect)基因的上位性效應(yīng)和顯性效應(yīng)聽名字就覺得挺繞的，聽起來就是一個基因?qū)α硪粋€基因的壓制效果，網(wǎng)上的介紹看起來云里霧里，還搬來染色體，標(biāo)記的性狀，感覺...
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建立者效應(yīng)(founder effect)和瓶頸效應(yīng)(bottleneck effect)我對種群遺傳學(xué)這塊一直不太熟悉，奈何實驗室中經(jīng)常有需要涉及到種群進(jìn)化這塊的內(nèi)容，所以以下的這塊介紹，大抵將給我自己聽的。 建立者效應(yīng) 建立者效應(yīng)...
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基因的可變剪切(alternative splicing)和蛋白異構(gòu)體(Protein isoform)寫這個文章的原因是因為我在用Trinity組裝轉(zhuǎn)錄組的時候，除去軟件的原因，在生物體內(nèi)有很多的可變剪切現(xiàn)象，定義就是一個mRNA前提可以通過不同...
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如何用fasq-dump解壓SRA文件
之前介紹了如何安裝sratoolkit, 可以看我之前寫的簡書http://www.lxweimin.com/p/188df05615c7[ht...
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fastq格式，如何快速計算fasta, fastq的reads數(shù)？
FASTQ fastq格式是一種基于文本的存儲生物序列和對應(yīng)堿基或者氨基酸質(zhì)量的文件格式，最初由桑格研究所（Wellcome Trust San...
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線粒體組裝軟件(2) NOVOPlasty
NOVOPlasty是一個小型環(huán)狀基因組的軟件，這意味著這個軟件可以組裝線粒體基因組和葉綠體基因組。這個軟件是一個perl的腳本，直接就可以運行...
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如何區(qū)分直系同源(Orthologs)和旁系同源(Paralogs)？做進(jìn)化的總是免不了區(qū)分直系同源和旁系同源，還有一個同源基因，我剛接觸進(jìn)化的時候經(jīng)常搞不懂這三貨，好在我老板不嫌我笨，兩遍三遍超有耐心的教，有老板...