發簡信
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記錄運行scvelo過程中的報錯TypeError: Neighbors.compute_neighbors() got an unexpected keyword argum...
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Github 2FA驗證最近在登陸github的時候，總是跳出下面這個界面： 強制要求2FA驗證，否則上不了github。驗證方式可以有以下幾種： 比較坑的一點是，gi...
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收集細胞注釋marker（持續更新）
"Myeloid": ["PTPRC", "CD68", "CD14", "CSF1R", "CD163", "LYZ"],"T cells":...
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pySCENIC下游可視化（python版本）
Python版SCENIC轉錄因子分析（四）一文就夠了-騰訊云開發者社區-騰訊云 (tencent.com)[https://cloud.ten...
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pySCENIC使用--代碼純享版
我這里的scRNA-seq前期是用scanpy做的，所以首先用scanpy把pySCENIC需要的信息導出來。 接下來用pySCENIC進行轉錄...
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monocle2的使用monocle2和monocle3的基本原理是一樣的，詳見monocle3系列之七：總結 - 簡書 (jianshu.com)[https://...
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R包的安裝方法都總結在這兒了！
在線安裝 1）CRAN的包 R的官方包倉庫（Comprehensive R Archive Network, CRAN）提供了大量的開源R包，使...
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monocle3系列之七：總結
monocle3系列之六：共調控基因模塊 - 簡書 (jianshu.com)[http://www.lxweimin.com/p/ca5028...
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monocle3系列之六：共調控基因模塊一旦找到了感興趣的差異基因，Monocle可以將它們分組為module。通過調用find_gene_modules()函數，在基因（而不是細胞）...