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    記錄運行scvelo過程中的報錯

    TypeError: Neighbors.compute_neighbors() got an unexpected keyword argum...

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    Github 2FA驗證

    最近在登陸github的時候,總是跳出下面這個界面: 強制要求2FA驗證,否則上不了github。驗證方式可以有以下幾種: 比較坑的一點是,gi...

  • 收集細胞注釋marker(持續更新)

    "Myeloid": ["PTPRC", "CD68", "CD14", "CSF1R", "CD163", "LYZ"],"T cells":...

  • pySCENIC下游可視化(python版本)

    Python版SCENIC轉錄因子分析(四)一文就夠了-騰訊云開發者社區-騰訊云 (tencent.com)[https://cloud.ten...

  • pySCENIC使用--代碼純享版

    我這里的scRNA-seq前期是用scanpy做的,所以首先用scanpy把pySCENIC需要的信息導出來。 接下來用pySCENIC進行轉錄...

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    monocle2的使用

    monocle2和monocle3的基本原理是一樣的,詳見monocle3系列之七:總結 - 簡書 (jianshu.com)[https://...

  • R包的安裝方法都總結在這兒了!

    在線安裝 1)CRAN的包 R的官方包倉庫(Comprehensive R Archive Network, CRAN)提供了大量的開源R包,使...

  • monocle3系列之七:總結

    monocle3系列之六:共調控基因模塊 - 簡書 (jianshu.com)[http://www.lxweimin.com/p/ca5028...

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    monocle3系列之六:共調控基因模塊

    一旦找到了感興趣的差異基因,Monocle可以將它們分組為module。通過調用find_gene_modules()函數,在基因(而不是細胞)...

個人介紹
上海交通大學醫學院附屬仁濟醫院
腫瘤免疫學
單細胞數據分析
讓學習成為一種習慣
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