前言
MaxQuant免費不開源,相對其他各大廠商壟斷的軟件來說,實在是良心軟件,尤其對labelfree數據準確性和蛋白鑒定數都有較好的優勢。缺點也是很明顯,Linux不友好。雖然官方也發文支持Linux系統MaxQuant goes Linux,但普遍認為體驗感不好。
官方關于這方面的文檔很少,只是寥寥數語描述幾句:
- Install Mono Framework 5.4.1 or higher
- Edit mqpar.xml file
- run MaxQuant
有個小哥看不下去,更為詳細的介紹了一下:MaxQuant in Linux,可參考他的倉庫:https://github.com/blahoink/maxquant_linux_guide
安裝
mono源碼安裝:
http://download.mono-project.com/sources/mono
MaxQuant安裝:
下載解壓即可。
試運行
/path/to/bin/mono /path/to/MaxQuant/bin/MaxQuantCmd.exe mqpar.xml
先占坑,后補充......