黃巾之亂平息后，曹操發出了討逆之文討伐董卓，孫策的父親孫堅也在其列。卻因為諸侯們各想著自己怎么發展而最終失敗，孫堅在討伐董卓時得到傳國玉璽，不料被袁紹知道，他讓劉表截擊孫堅，后與黃祖在襄陽決戰而不幸陣亡，但玉璽沒有丟失，但他手下無兵無馬，只能暫時依附在袁術手下。

一日，孫策正在壽春的將軍府嘆息、哭泣之時，朱治前來安慰，孫策知道這是自己父親的老部下，便說出了自己立功無數，確猶如袁術手下皮卡丘一樣的話，又說自己是江東猛虎之子，愧對父親。朱治便道，你可以向袁術借兵啊！這時呂范來到，說自己是袁術的謀士，袁術不是明主而特來投效孫將軍。又說道可以拿傳國玉璽做抵押可以向袁術借兵的良策，孫策哈哈大笑說這個買賣真值得。朱治暗道這小子真有氣概，呂范也說一點就明，真是明主。孫策于是去找袁術，然而袁術正在研究《十萬個為什么》紀靈和楊弘正在吹袁術的牛，紀靈還說自己的主子像愛因斯坦一樣厲害。孫策暗說這年代有愛因斯坦嗎？等他們吹完牛后孫策以傳國玉璽做抵押成功借來了兵馬，而袁術也大呼自己天才，楊、紀兩人也隨聲附和。

孫策在壽春舉兵，朱治、呂范先來報告，隨即程普、黃蓋來報告。黃蓋說：我們的速度真快，那么老還能搶先來報告。程普答道：我們可以參加110米跨欄為國爭光哦！孫策問道110米跨欄咋來的？又說道兩位老將軍幽默感又進步了。韓當也來報告，說自己的青春的勛章離不開熱血。孫策笑道：好，讓我看看你的表現。然后他們踏上了稱霸江東的第一步！

正在他向廬江進發時，看見了地公將軍張寶開始打劫，孫策便連忙去阻止，但是自己的部隊確陷入了黃巾軍的包圍。孫策喝道：殺出一條重圍。張寶嚇了一跳，說：這支軍隊太可怕了，一定要斬草除根。過了一會，周瑜來到。他看到孫策陷入重圍之后便又用了火王咒一張，成功打敗了黃巾軍，斬滅了張寶的軍隊，斬殺了張寶本人。周瑜和孫策兩兄弟也得以團聚，他們相互問候，孫策告訴了他孫堅死亡的消息之后周瑜嘆息，孫策和周瑜共同發出了誓言：有朝一日，我們必定提兵駐馬在洛陽城頭！孫策道：父親總以為這些話是戲言，現在時代不同，正是我們這些小輩而起之時，是我們兩立足新世界的目標，公瑾，時機已到，讓我們成為時代的締造者吧！周瑜道：正有此意，愿效犬馬之勞。周瑜讓孫策先回軍營，自己帶兩個人來見他。孫策回到軍營靜待，當聽到傳令兵的消息時，孫策大喜過望，而黃蓋、程普、朱治也吃了一驚，這個面前的人就是孫策的結義兄弟周瑜周公瑾，那后面便是有名的江東二張：張昭、張纮，他們兩個說了當今全國的局勢并提出了稱霸江東大計，先戰劉繇。孫策說：我正有此意。于是孫策軍真正開始了三年的稱霸江東之路。

孫策的軍隊開往牛渚，宣戰劉繇軍，第一步就是擊潰張英、搶占牛渚。周瑜在開戰時暗道：大哥，那兩個人不肯輕易佩服人，想得到他們就看你的造化了。張英擺出了鐵桶陣與孫策一戰。過了一會，孫策察覺到這果然是鐵桶陣，于是發怒死破鐵桶陣。也令張昭張纮兩人深深佩服。就當孫策所向披靡之時，牛渚的后方突然冒出周泰、蔣欽，他們火燒劉繇軍后方，大破劉繇軍。這時，太史慈來援救，可最終還是抵擋不住失敗的局面，牛渚失陷，而張英卻把責任推給了太史慈，正是因為太史慈沒得劉繇命令擅自出兵再加張英的賄賂，但因為是同鄉關系打其一百棍，此事平解。在軍事會議上孫策開始表彰有功的人，程普黃蓋開始演戲被孫策識破，周瑜來到說周泰蔣欽投降孫策，孫策軍的勢力又壯大了。他和黃蓋一起去神亭嶺打探消息。

在神亭嶺上，太史慈發現了孫策，于是便去活捉他。兩個人酣戰了三百回合，太史慈因為板傷而退，劉繇的軍隊也隨即而來。劉繇下令殺孫策者黃金千兩，孫策發怒，正巧周瑜率軍而至。經過苦戰才擊敗了劉繇，并且雙方傷亡非常慘重，只能采取和談的策略。

經過神亭嶺一戰后，傳令兵突然來報：“廬江附近出現了大批黃巾軍余黨。"周瑜勸孫策廬江是我們的后方，不能失陷，先去討伐黃巾軍吧”孫策說：“我們來一場黃巾的大洗禮。”當黃巾軍看到孫策的軍隊以后立刻潰不成軍，大敗而逃，鄧茂、孫仲、嚴政不知所向，和孫策單挑的那個黃巾大將也投降了孫策，周瑜也看出了這是試探性單挑，這個人是潘璋，他道出了孫策手里的槍是霸王槍，是當年西楚霸王所用之槍。程普黃蓋也道孫策的槍從來沒有見過，這把槍似乎帶有很強的氣。程普說自己縱橫沙場幾十年，黃蓋就說幾百年。孫策大喊：“該正經的就得正經”張昭、張纮佩服的五體投地，周泰哭著說這是個好主公。孫策也在想著霸王槍有著什么樣的秘密。劉繇通過強行征兵的政策來進攻孫策軍，太史慈反對，卻沒有一點用途。于是便開始守衛丹陽，命周瑜率一半的軍隊突襲曲阿。

在丹陽的守衛戰中，張纮用口才把薛禮罵死。劉繇的部隊聽到了曲阿被突襲的信息也趕快回師去救，可是這一切已經晚了，勝利的天平已經趨向了孫策的軍隊。

周瑜用計騙走了守衛曲阿門口的士兵，自己率軍猛進了曲阿的城池，陳武投降了孫策軍。劉繇軍大亂，太史慈又突然來援。過了一段時間，劉繇把自己的守兵殺了支援曲阿。陳橫率軍從水路救援，黃蓋的部隊也隨即而到。曲阿被攻陷，孫策軍的反擊又開始了。陳武告訴孫策，曲阿是劉繇的一個本營，他的另一個本營是秣陵，他絕對在那里駐扎。周瑜勸孫策立馬攻擊秣陵，孫策同意，立刻點兵進攻秣陵。劉繇知道了信息以后，派出了超級無敵頭號殺手勇猛無比雙子星于糜、樊能來迎戰孫策。孫策以鍛煉歸來的潘璋為先鋒，由周瑜先去督戰，自己一會便到。但是在戰斗中情況不容樂觀，太史慈來到，周瑜領軍去抵御。潘璋的部隊也險些被殺敗。就在孫策軍無望之時，孫策的突然出現逆轉了整個戰局，他命令陳武把潘璋救出來，自己去一挑二。陳武阻止無效無奈，只好去實行命令。孫策先一擊擒住了于糜，樊能想突襲，反而被孫策大喝一聲而死。于糜也沒有發出聲音，原來是被孫策掐死了。劉繇軍的部隊無不驚呼：“簡直是霸王重生啊！”孫策軍的部隊也尊稱孫策為“小霸王”。并且孫策本人突然獲得極強的力量，孫策軍士氣大振，劉繇軍大敗，秣陵失陷。

孫策攻陷秣陵后，不給予劉繇喘息的機會，馬上給予追擊，追擊的途中遇到太史慈斷后，孫策馬上下令撤兵，在涇縣再決戰。太史慈暗想：絕境真的可以改變一個人。孫策事不宜遲，立馬籌備進攻涇縣的事宜。但決戰前得到了張英寫給孫策軍的一封信，信中寫著缺糧。孫策料到太史慈肯定襲擊自軍糧庫，親自去誘敵捕捉太史慈。襲糧失敗后，劉繇派出了伏兵。周瑜早已料到，反而士氣大振。太史慈被孫策抓獲，城外的部隊損失殆盡，劉繇下令關上城門。過了一會，丁奉來到破壞城門，周瑜驚嘆世上居然有如此神力之人。孫策下令進攻，劉繇軍背水一戰。經過艱苦卓絕的戰斗，蔣欽殺了陳橫，陳武殺了劉繇，笮融戰死，劉繇軍宣告滅亡。丁奉告訴孫策涇縣城門的秘密、太史慈如孫策所愿投降，并和孫策約定招募自己的士兵一起來投靠，明日正午十二點之前必到。孫策答應，但是眾將不信，到了明天正午，太史慈果真來到，從此以后諸將更加佩服孫策。但孫策并沒有停息占領江東的腳步，繼續開往吳郡，宣戰嚴白虎。而此時此刻北方的局面卻是曹操打敗中原的諸侯，找到了落魄的漢獻帝，遷都許昌，改名許都，自立為大漢丞相，新時代的巨輪已經起航。張英也跑到了嚴白虎手下當上了首席顧問，太史慈知道這是賄賂，誓要砍死張英。而嚴白虎的弟弟嚴輿卻在想著和孫策平分江東。

在戰斗的過程中，嚴輿大敗孫策，張英縱火逃跑，被追來的太史慈所殺，孫策得到吳郡以后黃蓋卻是奇怪:如此大的城池居然拱手送給我方，這太奇怪了。“孫策說道：“不要管他，下一站將會非常艱苦。幼平，你別去了，你去宣城把我二弟接回來。”孫策軍絲毫不留給他們喘息的機會，開始進軍余杭。

在余杭保衛戰中，嚴白虎讓嚴輿當先鋒抵御孫策軍。嚴輿不敵，退守后方，嚴白虎開始搶劫財物并關上城門。孫策追擊嚴輿之時。凌統、凌操兩人出現，不管青紅皂白兩軍都開始打。孫策不理，追到嚴輿后，嚴輿說：孫將軍，我們平分江東如何？孫策說：“要先和我打一架，讓你的實力得到我的認同。”嚴輿大驚，但是還是提刀縱馬而上，一合便被孫策斬落馬下。孫策說：“這樣的實力還敢來和我平分江東，癡人說夢。”嚴白虎看見了自己弟弟被殺，盡起吳郡之兵開始了最后的掙扎。然而這已經無濟于事，孫策軍終究攻下了余杭。凌統凌操兩人知道這是孫策的部隊非常愧疚，隨即投降。正當孫策開心之時，守衛宣城的全綜噩報傳來：周泰和孫權被山賊殺的困在宣城，情況已經非常危急，請少主速速救援。周瑜說出了宣城的情況，孫策無奈，只好回宣城救孫權，停止了追擊嚴白虎的事宜。

在救援宣城的戰斗中，經過一番苦戰，終于把孫權和周泰救出來了，周泰本人所中十二槍。華佗來到治療周泰，他驚嘆周泰的意志，又說孫策是一個被天下注視的人，讓孫策好好干。

過了一段時間，孫策決定進攻會稽城，而此時的嚴白虎和王朗已經湊合在一塊了。在會稽之戰中，周泰請求孫策自己宣戰。孫策同意，董襲出現殺掉嚴白虎、太史慈殺掉周聽，孫策活捉王朗，用王朗的狗命換來詔書討伐仇敵劉表。董襲、虞翩投降孫策，孫策從今以后完全稱霸江東。兩年后，孫策和周瑜游玩山水，找到一戶人家，周瑜娶小喬，孫策娶大喬。張昭得到一封信，卻被孫策道破意思，張昭連連稱贊孫策是明主。而此時的袁術軍卻是這樣一種景象：袁術說自己天才時的悲慘經歷，考紀靈和楊弘玉璽的作用。袁術預料他們答不出來，所以就舉行了稱帝大典，然后命楊弘聯絡CCTV、TVB、ATV、BBC等中外的大型媒體宣布自己稱帝的事宜。袁術稱帝的信息被曹操知道了，聯合孫策、劉備、呂布討伐袁術。

壽春之戰的時候，曹操、呂布、關羽突然感受到一股很強的氣息，原來是孫策軍到達。袁術大罵孫策，卻被孫策硬生生的罵了回去。結果袁術抵擋不住四支軍隊的攻擊，大敗壽春，袁術、紀靈、楊弘全體陣亡，而曹操的目的也完全達到。曹操也稱霸中原，和黃河以北的袁紹形成了對峙的狀態。

曹操討伐呂布的時候，孫策執意要去援救，他告訴張昭：是因為我們之間在壽春的約定，也因此救出了呂布，成為了孫策稱霸天下的一把好手。

救援完呂布之后，孫策馬上開始了突襲許昌迎取漢帝的事宜，卻被曹操所知。曹操的軍師郭嘉看出了孫策的意圖，命曹彰、曹休、曹純三人為先鋒，曹仁為中軍、曹洪為后軍緊急救援許昌。在孫策猛攻許昌之時，他不知道虎豹騎已經到達了他的面前，因而與虎豹騎戰斗，但孫策本人受了重傷不見蹤影，孫策軍只好撤退，孫家只能在江東另尋他路了。