????在使用R語言進行數據可視化過程中，大家可能會遇到數據中樣本名稱順序與圖形中樣本展示順序不一致的問題，或者是我們想要讓圖形中的樣本順序按照我們指定的進行繪制。今天，小編就給大家用實例進行講解如何解決如上問題！
R包的安裝及加載
rm(list=ls())#clear Global Environment
setwd('D:\\桌面\\繪圖技巧')#設置工作路徑
#安裝包
# install.packages("ggplot2")
# install.packages("ggprism")
# install.packages("reshape2")
# install.packages("cowplot")
#加載R包
library(ggplot2)
library(ggprism)
library (reshape2)
library(cowplot)
數據加載及預處理
#使用R代碼生成一些數據
df <- data.frame(
A=c(0.5,0.3,0.1,0.05,0.05),
B=c(0.1,0.2,0.6,0.01,0.09),
C=c(0.1,0.5,0.2,0.1,0.1),
D=c(0.05,0.25,0.3,0.3,0.1),
E=c(0.2,0.15,0.4,0.2,0.05))
df$tax=rownames(df)#將行名加入到數據中
#變量格式轉換,寬數據轉化為長數據,方便后續作圖
df1 <- melt(df)
names(df1)[c(2,3)] <- c("group","values") #修改列名
head(df1)#預覽數據
image.png
常規繪圖
p1<-ggplot(df1, aes( x = group,y=100 * values,fill = tax))+#geom_col和geom_bar這兩條命令都可以繪制堆疊柱形圖
geom_col(position = 'stack', width = 0.6)+#geom_bar(position = "stack", stat = "identity", width = 0.6)
scale_y_continuous(expand = c(0,0))+# 調整y軸屬性，使柱子與X軸坐標接觸
labs(x="Group",y="Relative Abundance(%)",#設置X軸和Y軸的名稱以及添加標題
fill="tax")+
guides(fill=guide_legend(keywidth = 1, keyheight = 1)) +#修改圖例的框大小
theme_prism(palette = "candy_bright",
base_fontface = "plain", # 字體樣式，可選 bold, plain, italic
base_family = "serif", # 字體格式，可選 serif, sans, mono, Arial等
base_size = 16, # 圖形的字體大小
base_line_size = 0.8, # 坐標軸的粗細
axis_text_angle = 45)+ # 可選值有 0，45，90，270
scale_fill_prism(palette = "colors")#使用ggprism包修改顏色
p1
image.png
調整X軸樣本展示順序
####按照自己的意愿修改x軸顯示的順序
#將樣本名構造為factor類型數據并指定順序
df1$group <- factor(df1$group,levels = c('B','A','C','E','D'))
#繪圖
p2<-ggplot(df1, aes( x = group,y=100 * values,fill = tax))+#geom_col和geom_bar這兩條命令都可以繪制堆疊柱形圖
geom_col(position = 'stack', width = 0.6)+#geom_bar(position = "stack", stat = "identity", width = 0.6)
scale_y_continuous(expand = c(0,0))+# 調整y軸屬性，使柱子與X軸坐標接觸
labs(x="Group",y="Relative Abundance(%)",#設置X軸和Y軸的名稱以及添加標題
fill="tax")+
guides(fill=guide_legend(keywidth = 1, keyheight = 1)) +#修改圖例的框大小
theme_prism(palette = "candy_bright",
base_fontface = "plain", # 字體樣式，可選 bold, plain, italic
base_family = "serif", # 字體格式，可選 serif, sans, mono, Arial等
base_size = 16, # 圖形的字體大小
base_line_size = 0.8, # 坐標軸的粗細
axis_text_angle = 45)+ # 可選值有 0，45，90，270
scale_fill_prism(palette = "colors")#使用ggprism包修改顏色
p2
#拼接圖
plot_grid(p1,p2, labels=c('A','B'), ncol=1, nrow=2)#拼圖及標注
image.png
調整Y軸展示順序
#####按照自己的意愿修改y軸顯示的順序
df1$tax <- factor(df1$tax,levels = c('5','1','3','2','4'))
#繪圖
p3<-ggplot(df1, aes( x = group,y=100 * values,fill = tax))+#geom_col和geom_bar這兩條命令都可以繪制堆疊柱形圖
geom_col(position = 'stack', width = 0.6)+#geom_bar(position = "stack", stat = "identity", width = 0.6)
scale_y_continuous(expand = c(0,0))+# 調整y軸屬性，使柱子與X軸坐標接觸
labs(x="Group",y="Relative Abundance(%)",#設置X軸和Y軸的名稱以及添加標題
fill="tax")+
guides(fill=guide_legend(keywidth = 1, keyheight = 1)) +#修改圖例的框大小
theme_prism(palette = "candy_bright",
base_fontface = "plain", # 字體樣式，可選 bold, plain, italic
base_family = "serif", # 字體格式，可選 serif, sans, mono, Arial等
base_size = 16, # 圖形的字體大小
base_line_size = 0.8, # 坐標軸的粗細
axis_text_angle = 45)+ # 可選值有 0，45，90，270
scale_fill_prism(palette = "colors")#使用ggprism包修改顏色
p3
#拼接圖
plot_grid(p1,p3, labels=c('A','B'), ncol=1, nrow=2)#拼圖及標注
image.png
總結
????通過以上示例展示，大家應該也明白了其中的訣竅，那就是將我們的樣本名稱轉換為factor類型數據，然后指定其順序就可以在繪圖過程中得到你所指定的樣本順序了！
