前言:
我發現有些童鞋在回復關鍵詞時,如果沒有得到對應的回復內容,也許是你輸入的關鍵詞錯誤了,請你重新輸入即可。我這里都是按進準匹配進行回復的,目前主要是按我發內容的時間作為“關鍵詞”,如今天“20220308”,8個數字。
上一期轉錄組上游分析教程系列 | 從NCBI下載SRA數據開啟了2個微豆的付費(1元=7個微豆),結果正沒有老鐵支持。應該是自己的內容不好導致的。因此,后續還是繼續分享吧。也感謝,下面8位老鐵的支持哦!本期的電子版可以私下我,發送給你們,如果需要。
原文鏈接:一、從NCBI中下載SRA數據 | 轉錄組上游分析教程系列
## 安裝 lftp
conda install -y lftp
(base)PowerEdge-R840:~$ conda install -y lftp
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done
==> WARNING: A newer version of conda exists. <==
current version: 4.8.3
latest version: 4.11.0
Please update conda by running
$ conda update -n base conda
## Package Plan ##
environment location: /home/data/ssy10/miniconda2
added / updated specs:
- lftp
The following packages will be downloaded:
package | build
---------------------------|-----------------
gettext-0.19.8.1 | h0b5b191_1005 3.6 MB conda-forge
lftp-4.9.2 | h87db986_0 6.4 MB conda-forge
------------------------------------------------------------
Total: 10.0 MB
The following NEW packages will be INSTALLED:
gettext conda-forge/linux-64::gettext-0.19.8.1-h0b5b191_1005
lftp conda-forge/linux-64::lftp-4.9.2-h87db986_0
libiconv conda-forge/linux-64::libiconv-1.16-h516909a_0
Downloading and Extracting Packages
lftp-4.9.2 | 6.4 MB | ################################################## | 100%
gettext-0.19.8.1 | 3.6 MB | ################################################## | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
1.1.1 lftp的操作使用
在 lftp 配置文件 ~/.lftp/rc 中設置 pget 使用的線程數
set pget:default -n 10
小杜的生信筆記”公眾號、知乎、簡書平臺,主要發表或收錄生物信息學的教程,以及基于R的分析和可視化(包括數據分析,圖形繪制等);分享感興趣的文獻和學習資料!