一、從NCBI中下載SRA數據 | 轉錄組上游分析教程系列

前言:

我發現有些童鞋在回復關鍵詞時,如果沒有得到對應的回復內容,也許是你輸入的關鍵詞錯誤了,請你重新輸入即可。我這里都是按進準匹配進行回復的,目前主要是按我發內容的時間作為“關鍵詞”,如今天“20220308”,8個數字。

上一期轉錄組上游分析教程系列 | 從NCBI下載SRA數據開啟了2個微豆的付費(1元=7個微豆),結果正沒有老鐵支持。應該是自己的內容不好導致的。因此,后續還是繼續分享吧。也感謝,下面8位老鐵的支持哦!本期的電子版可以私下我,發送給你們,如果需要。


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## 安裝 lftp 
conda install -y lftp
(base)PowerEdge-R840:~$ conda install -y lftp 
Collecting package metadata (current_repodata.json): done 
Solving environment: done 
 
 
==> WARNING: A newer version of conda exists. <== 
  current version: 4.8.3 
  latest version: 4.11.0 
 
Please update conda by running 
 
    $ conda update -n base conda 
 
 
 
## Package Plan ## 
 
  environment location: /home/data/ssy10/miniconda2 
 
  added / updated specs: 
    - lftp 
 
 
The following packages will be downloaded: 
 
    package                    |            build 
    ---------------------------|----------------- 
    gettext-0.19.8.1           |    h0b5b191_1005         3.6 MB  conda-forge 
    lftp-4.9.2                 |       h87db986_0         6.4 MB  conda-forge 
    ------------------------------------------------------------ 
                                           Total:        10.0 MB 
 
The following NEW packages will be INSTALLED: 
 
  gettext            conda-forge/linux-64::gettext-0.19.8.1-h0b5b191_1005 
  lftp               conda-forge/linux-64::lftp-4.9.2-h87db986_0 
  libiconv           conda-forge/linux-64::libiconv-1.16-h516909a_0 
 
 
 
Downloading and Extracting Packages 
lftp-4.9.2           | 6.4 MB    | ################################################## | 100%  
gettext-0.19.8.1     | 3.6 MB    | ################################################## | 100%  
Preparing transaction: done 
Verifying transaction: done 
Executing transaction: done

1.1.1 lftp的操作使用

在 lftp 配置文件 ~/.lftp/rc 中設置 pget 使用的線程數

set pget:default -n 10


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