biostar hand book 學習第一篇
2017.10.23:00 虛擬系統安裝
待更新
就這個東西寫了兩遍,就是沒有及時保存,同學們,及時保存很重要啊!!!話說Tyora居然沒有自動保存功能,差評。
虛擬系統安裝
對于生信學習來說,linux的學習是必不可少的,對于多數初學者來說,肯定是沒有裝好系統的集群來給大家使用,而且集群并不適合初學者學習和了解這個系統,因為學習的最好方式就是不斷的嘗試,所以一個大的集群可不能給大家拿來折騰,虛擬系統在功能上完全沒用任何的區別(當然大的集群可能在提交任務等有那么一點區別),我們可以拆開掰碎了去了解這個系統,系統搞壞了,大不了就是重新裝一個。
1. 虛擬機軟件及系統鏡像準備
虛擬機軟件
虛擬機就是運行虛擬系統的一個容器,同類軟件也有好幾種,我選擇了VMware Workstation Pro,總體來說可以滿足我的需求。
系統鏡像的準備
Ubuntu
這個發行版的桌面比較友好,桌面版安裝也比較人性化。最新版為17,當然16更加的成熟穩定。
bio-linux
這個發行版實際上就有點相當于Windows系統預裝了一些軟件做成了鏡像,同理,它就是Ubuntu預裝了一些我們常用的生信軟件,優點就是免去了很多我們裝軟件的煩惱,當然這不太利于我們對于linux軟件編譯安裝的學習。
centos
對于初學者來說,我還是比較推薦Ubuntu的,但是如果進行后期一點的學習,我還建議安裝centos,因為我們的學習很多時候都是為了使用集群做準備的,而Ubuntu和centos在操作上還是有些區別的。
?
2. 虛擬系統的安裝
下面我就以VMware Workstation Pro安裝bio-linux為例演示虛擬系統的安裝
系統的安裝
安裝VMware Workstation Pro軟件,打開軟件新建一個虛擬機。
![]()
?
選擇自己要安裝的鏡像,這里就選擇bio-linux。
![]()
之后就一直點下一步就好了。
第一次打開虛擬機,注意這個時候系統還并沒有裝好。開啟虛擬機。
![]()
之后就后一般的裝系統一樣。一直選擇下一步即可,分區就按默認的設置就行。
![]()
虛擬系統的硬件設置最好是不要超過你電腦硬件的一半,如果你不想你的電腦開個虛擬機就卡的不行的話。當然內存小于8G的電腦也不要裝什么虛擬機了。
![]()
話說到此為止,你已經有一個可以使用的虛擬系統了。
如何舒服的使用你的虛擬系統。
這個時候的虛擬系統并不完美,還存在以下兩個問題。
- 屏幕分辨率的問題
這個問題可以通過安裝虛擬機的插件VMware Tool來解決。
虛擬系統和電腦交互的問題。
- 共享文件夾問題
前提是已經裝好了VMware Tool,在虛擬系統設置設置一個共享文件夾tmp,然后我們就可在虛擬系統的/mnt/htfs/目錄下找到我們的共享文件夾了。我們可以把我們要操作的比較大一點的文件放在這個文件夾里,這個過程實質就是一個盤的掛載。
![]()
![]()
ssh服務的問題
其實大多數的發行版應該都是裝了這個服務的,當然為了確保成功,不妨用了apt-get install ssh再裝一遍。這個時候我們就可以ifconfig命令獲得虛擬系統的ip地址了。這個時候我們就可以用Xshell等終端模擬器愉快的訪問我們的虛擬系統了。
![]()
![]()
![]()
?
?