《惡意》中用兩個第一人稱的事件敘述，一個是野野口修，一個是警官加賀恭一郎。

故事的開始交代幾個主人公，野野口修，日高邦彥——暢銷書作家，理惠——日高邦彥的妻子，藤尾和他的妹妹藤尾美彌子。其中野野口修，日高邦彥，藤尾是從小學就一起的同學。

故事開始，以野野口修為第一人稱的方式敘述他去拜訪日高邦彥一家，因為日高邦彥和他的妻子后天將要移民加拿大，而在這之前編輯要催他還有三十頁才完成的書稿，所以得知日高邦彥任務很重，野野口修在交談時提及碰到日高邦彥的鄰居，日高邦彥說是因為他的貓被殺一事，而他——日高邦彥正是殺害這只貓的兇手。

原因很簡單，因為這只貓經常來自己院子里拉糞，以至于房子到現在還租不出去。于是就毒死了，鄰居懷疑是他所為，所以一直來這找證據。

野野口修很不爽，這時藤尾的妹妹藤尾美彌子到來，是因為日高邦彥在一部暢銷書中將他們一家的隱私曝光，要求日高邦彥重寫，這時候野野口修不好在場只好離去，此時的時間大約5點半左右。

野野口修現在寫兒童讀物，回到家之后童子社一位叫大島的人，此時大約為6點，此時接到日高邦彥的電話，說有急事找他，由于大島在的原因，時間訂到了8點，之前，野野口修還和大島一塊去吃飯。

8點的時候，野野口修到了日高邦彥的家，發現里面全是黑的，于是就給他的妻子理惠打電話，他自己則去附加的一家咖啡廳等候，算好時間，大約8點40的時候，野野口修再次回來，正好碰到他的妻子理惠過來，理惠在說著按理說日高邦彥應該在家才對，開門之后發現日高邦彥已經遭到殺害。之后，二人報警，警察傳他們二人問話，了解了之前的情況。根據野野口修的說法，由于六點之后他們還通過電話，并且在日高邦彥電腦前發現編輯催稿的30頁已經完成27頁，但是野野口修表示，一個人至多一小時能寫6頁，但還是由于野野口修6點之后與他通過電話，初步判定死亡時間是6點之后。野野口修由于是個作家的原因，打算將此事情寫成小說，加賀恭一郎，就是負責辦案的警官，知道后說要讀。

小說的下面部分是以加賀恭一郎為一人稱敘述，加賀恭一郎的懷疑對象有兩個，一個是藤尾美彌子，她有殺害動機，但是他有完美的不在場證明，證明人有兩個，他的未婚夫和他未婚夫的上司，加賀恭一郎認為沒什么問題，因為沒有那個領導會為自己下屬的未婚妻做偽證；另一個懷疑對象便是野野口修了，野野口修也有幾近完美的不在場證明，大島，已經一起與大島吃飯的飯店服務員，還有在等候理惠來的時候的咖啡工作人員，都沒什么破綻，但也不是全無漏洞，一個就是8點到日高邦彥的家到等理惠來的時間，這段時間他有時間潛入將其殺害，另一個就是日高邦彥這點時間寫不了二十七頁，并且負責跟他對接的編輯也說感覺像是另一個寫的。

后來，加賀恭一郎終于查清，兇手就是野野口修，兇手的死亡時間其實是6點之前，5點半左右，他離開日高邦彥家之后并沒有直接回家，而是又返回去稱大家都離開，將其殺害，然后在路上又叫大島來取稿，從而讓大島見證的野野口修和日高邦彥的通話，當然是野野口修通過一些手段造成的假象，只是為了讓大家以為日高邦彥的死亡時間是6點之后，而只要是六點之后的死亡，大島也就為他做了不在場證明。野野口修承認了自己殺害日高邦彥嗎，但是對作案動機就是不說。并且告訴警察想怎么寫就怎么寫，在法官面前自己不會翻供。后來野野口修因為舊疾復發去了醫院。

加賀恭一郎為了查明真正的作案動機，去搜查嘉禾恭一郎的住處，發現很多原稿，竟然都是日高邦彥發表過的，大致相同，但還是有些細節是不同的，加賀恭一郎這個時候推測：野野口修是日高邦彥的影子作家，日高邦彥之前的暢銷作品都是野野口修所作，二人應該是有什么合作，但是并無發現日高邦彥有固定的給野野口修打款的痕跡。又或者野野口修有什么把柄在日高邦彥手上，被迫為他寫稿。

于是加賀恭一郎去醫院和野野口修確認，野野口修不承認，說那些原稿只是因為崇拜，沒那么復雜，如果真像你說的，我是影子作家的話，這是件光榮的事情，不會不承認。

加賀恭一郎覺得很有道理，但是種種證據顯示，野野口修就是影子作家，于是，加賀恭一郎有一個大膽的推測，可能是因為女人。帶著這個推測，再次搜查野野口修的住處，果然發現了女人的圍裙，和要送給女人的禮盒，項鏈，后來，在一本書中，發現了一張女人照片，經過調查之后，這個女人，就是日高邦彥的前妻——初美小姐。

但后來初美小姐發生意外交通事故，加賀恭一郎了解到野野口修認為初美的死并不是意外。

在這些證據下，野野口修終于“承認”：初美小姐告訴野野口修，日高邦彥很欣賞他的創作，但是卻嫉妒他，不想讓他被編輯發現，當時自己和日高邦彥關系不錯，常去日高家，后來與初美互相喜歡，加上野野口修感到初美受的委屈，二人決定殺害日高邦彥。但是不幸被發現，還被日高邦彥錄了像，日高邦彥以此威脅他代為寫作，野野口修考慮到如果這件事公布出去，會對初美造成名聲的影響，被迫屈服，后來初美死了，可是日高邦彥還咬著不放，于是狠下心來將他勒死，之前之所以不交代影子作家的事，就是怕這件事交代了，初美的事也會瞞不住……

看上去真相大白，但是加賀恭一郎發現仍有許多疑點，接下來的調查讓他吃驚的發現：真相來了一個一百八十度的大轉彎。

事實的真相竟然是：他根本不是日高邦彥的影子作家，他和初美的地下戀情的事也是子虛烏有，那只貓也是他野野口修殺的然后嫁禍日高邦彥，為的就是制造一個日高邦彥素質很低下的形象。之前的證據都是野野口修引導自己發現的，野野口修就是設計自己被抓，然后引導警察發現他提前設計好的“真相”，就是要把日高邦彥的名聲毀掉，這世人反而同情他這個始作俑者。而這么做的原因只有一個：我就是看他不爽！

原因很簡單，殺人手法也很平實，但是卻讓人感感到一陣深深的惡意！

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