Shuffle Service導致NM OOM問題分析(續)

今天有朋友問之前NodeManager被Shuffle拉掛的問題,借此機會將之前分析的另一文檔整理一下分享出來。

現象描述及分析

9月27日10時左右,編號為2611節點執行應用時發生先前描述的NM OOM問題。其中觸發該問題的應用的部分信息如下所示:

  • 應用Stage信息如下所示:
Stages for All Jobs

由該圖可知,Stage3包含10萬+Map任務,Stage4有3000個Reduce任務。
Stage3 中每個Map任務會將處理的數理 Hash成3000份并存入一個文件當中。

  • Stage3階段, 編號2611節點中分配的Executor信息:


    Aggregated Metrics by Executor

應用其申請100個Executor, 其中4個Executor落在編號為2611節點(為單節點Executor最多的情況),2611中4個Executor共執行3512個Map Task. 即理論上會有3512個shuffle臨時文件落在該節點。因為Reduce任務數為3000,所示每個臨時文件中包含3000個reduce task的數據(備注:任務數據本無傾斜,調度原因導致傾斜)。

3000個reduce任務會到編號為2611中的3512個文件中取回屬于自己的數據,所以共需要打開30003512次文件(FileInputStream數目),然而:
由FailedStages信息可知已執行的Task數約為2200(之后出現錯誤退出)
則在編號2166節點打開文件次數大約為 3512 * 2200 = 7726400次(考慮索引文件時,該值
2,2611節點約創建1500萬FileInputStream).

而通過分析OOM時Dump文件,結果顯示Finallizer堆集數量為430萬+, 因此理論上Shuffle Service有致使Finallizer堆集至430萬+的可能.

應用重試結果

NM掛掉之后, 任務拋出下述異常:

FetchFailed(BlockManagerId(69, ****2611.****.com, 7337)

重新提交后,應用正常執行完成,分析Executor列表,最多兩個Executor分配至同一個Node。

問題?

由Shuffle Service原理可知,同一個NM上的所有Executor共用同一個服務, 因此在某個NM上運行的Executor過多時,其對外提供Shuffle服務的負擔會變重…特別是同一個應用的多個Executor調度到同個NM時,問題會更加嚴重, 因為這些Executor的shuffle數據將同一時間被reduce拉取(不同應用會有錯峰的可能)。

因此,RM如何為Spark APP分配container會影響Shuffle Server的負載強度,即OOM發生的風險。

==Yarn 調度時是否可以增加如下機制:==

  • ==對同一APP的Container進行調度時,打散到多個NM, 類似于Spark Streaming中Receiver的調度,盡量避免隸屬同一APP的Container在同一個NM上堆積==

此舉可減輕Shuffle Server負擔,可在一定程度上避免OOM發生,再結合之前“Shuffle Service 導致NM OOM問題分析”解決方案,可更好的解決NM 掛掉問題

另外:
同一應用中任務在同一時間會必然競爭相同的資源,若隸屬同一個應用的Container過多的落在同一NM上時,在邏輯資源隔離的背景下,理論上會降低任務執行效率。
若將其打散,則應用在某Node上的Container會與其它應用重合,則存在相同資源錯峰使用的可能,在一定程度上還會比相同應用Container堆疊時作業執行效率高。

附 網絡信息


//由上述Stage信息圖可知Stage4  shuffle任務 從09:39開始提交執行,其網絡使用情況如下所示:
9:52左右NM日志中開始出現異常信息…  10:05左右NM掛掉…

由該信息可知,shuffle時fetch請求量較非shuffle階段高很多…

(totsck: socket總數量, tcpsck用于TCP的socket數量)
09:36:01 AM    totsck    tcpsck    udpsck    rawsck   ip-frag    tcp-tw
09:37:01 AM       682       341        10         0         0      5081
09:38:01 AM       711       345        10         0         0      8289
09:39:01 AM       690       353        10         0         0     10512
09:40:01 AM       880       512        10         0         0      8532
09:41:01 AM      1013       660        10         0         0      5957
09:42:01 AM      1879      1589        10         0         0      3357
09:43:01 AM      2717      2434        10         0         0      1251
09:44:01 AM      3445      3150        10         0         0       629
09:45:01 AM      4061      3784        10         0         0       291
09:46:01 AM      4727      4451        10         0         0        81
09:47:01 AM      5639      5362        10         0         0        62
09:48:01 AM      6463      6187        10         0         0        72
09:49:01 AM      7447      7160        10         0         0        94
09:50:01 AM      8453      8176        10         0         0        56
09:51:01 AM      9638      9364        10         0         0       108
09:52:01 AM     10740     10466        10         0         0        56
09:53:01 AM     11808     11533        10         0         0       323
09:54:01 AM     12634     12357        10         0         0       207

09:54:01 AM    totsck    tcpsck    udpsck    rawsck   ip-frag    tcp-tw
09:55:01 AM     13742     13468        10         0         0        71
09:56:01 AM     14859     14584        10         0         0        35
09:57:01 AM     16005     15725        10         0         0        53
09:58:01 AM     17124     16834        10         0         0        71
09:59:01 AM     18213     17925        10         0         0        53
10:00:01 AM     19134     18804        10         0         0        40
10:01:01 AM     19792     19464        10         0         0        38
10:02:01 AM     20394     20102        10         0         0        48
10:03:01 AM     21017     20690        10         0         0        53
10:04:02 AM     21077     20789        10         0         0        26
10:05:01 AM     21897     21584        10         0         0        42
10:06:01 AM       710       393         9         0         0       144
10:07:01 AM       726       404         9         0         0        49

注: 官方Spark 2 版本做了眾多與Shuffle Service相關工作(SPARK-21475,20994,20426等),可以拉取相關patch解決該問題。
另外 Yarn社區也有提出System Container的概念,旨在將Shuffle Service等AuxiliaryServices獨立于NodeManger之外,可以做為終極解決方案的參考,地址見:https://issues.apache.org/jira/browse/YARN-1593

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