Petuum之安裝運行

聽聞Petuum大名已久,這幾天部署了一番。
Petuum是Eric Xing實驗室做的分布式機器學習平臺,詳情可以閱讀謝澎濤在知乎的回答
http://petuum.github.io/papers/PetuumDataScienceSummit2015.pdf

Petuum有Bosen(數據并行)和Strads(模型并行)兩個主要組成部分。
B?sen使用的一致性協議是受限異步,既可以獲得與完全異步相似的性能,又可以保證機器學習算法的近似正確性。
Strads對機器學習模型參數的更新進行細粒度的調度,根據參數的優先級自動調整更新次序,并根據參數的相關性防止不安全的并行。
除此之外還有一個基于GPU的parameter server分布式框架Poseidon(波塞冬)項目。

本來一開始想裝在mac上面跑跑單機版程序的,后來發現依賴的庫包的確是有些多,就放棄了。轉而在mac上裝了三臺Ubuntu的虛擬機(每個2核2G內存),只是配置和調試代碼還是足夠的。大的程序以后再轉到大集群上去。并且裝好了hadoop。附Hadoop2.6的配置 http://www.powerxing.com/install-hadoop-cluster/

編譯

官方提供的安裝文檔足夠詳細。分為兩種:Configuration and Machine Files for Petuum AppsRunning on Hadoop clusters with YARN/HDFS,第一種是基于NFS共享文件系統的,第二種是基于HDFS的。一開始給人的錯覺(包括配置文件里面的描述)是,第一種不需要hadoop,第二種需要。事實上兩種都是需要hadoop作為底層框架的。

我用的Ubuntu14.04的鏡像。除去官網的配置之外,還需要幾個依賴包。
apt-get
install libtcmalloc-minimal4 libtcmalloc-minimal4-dbg libgoogle-perftools-dev libpopt0 libpopt-dev

編譯第三方包的時候,直接make會報錯

p.p1 {margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px; font: 11.0px Menlo}span.s1 {font-variant-ligatures: no-common-ligatures}
src/base/low_level_alloc.cc: In static member function 'static bool LowLevelAlloc::DeleteArena(LowLevelAlloc::Arena*)':
src/base/low_level_alloc.cc:337:44: error: 'munmap' was not declared in this scope
munmap_result = munmap(region, size);

逐一排查之后,問題出在gperftools上面。因為直接install了libgoogle的,所以暫時先跳過去了。目前還沒有出問題。

從編譯的角度講,bosen的編譯要遠復雜與strads的。

運行

基于NFS(我這里mac的共享文件夾天然充當了NFS)的bosen因為只需要在編譯一遍,其他幾臺slave機器上就可以運行了。但是需要注意的是,環境在幾臺機器上也要保持一致。例如,hadoop的path,還有需要apt-get install的庫(例如跑NMF時所有機器上都需要安裝libtcmalloc-minimal4)。

然后每個算法都需要單獨make。數據是個問題。幾個算法都只有格式沒有數據,需要自己搞定。另外,作為算法演示,幾個方法都提供了一個隨機數據生成器。

最后編輯于
?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯系作者
平臺聲明:文章內容(如有圖片或視頻亦包括在內)由作者上傳并發布,文章內容僅代表作者本人觀點,簡書系信息發布平臺,僅提供信息存儲服務。
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個濱河市,隨后出現的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 229,001評論 6 537
  • 序言:濱河連續發生了三起死亡事件,死亡現場離奇詭異,居然都是意外死亡,警方通過查閱死者的電腦和手機,發現死者居然都...
    沈念sama閱讀 98,786評論 3 423
  • 文/潘曉璐 我一進店門,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來,“玉大人,你說我怎么就攤上這事?!?“怎么了?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 176,986評論 0 381
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵,是天一觀的道長。 經常有香客問我,道長,這世上最難降的妖魔是什么? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 63,204評論 1 315
  • 正文 為了忘掉前任,我火速辦了婚禮,結果婚禮上,老公的妹妹穿的比我還像新娘。我一直安慰自己,他們只是感情好,可當我...
    茶點故事閱讀 71,964評論 6 410
  • 文/花漫 我一把揭開白布。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪。 梳的紋絲不亂的頭發上,一...
    開封第一講書人閱讀 55,354評論 1 324
  • 那天,我揣著相機與錄音,去河邊找鬼。 笑死,一個胖子當著我的面吹牛,可吹牛的內容都是我干的。 我是一名探鬼主播,決...
    沈念sama閱讀 43,410評論 3 444
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼!你這毒婦竟也來了?” 一聲冷哼從身側響起,我...
    開封第一講書人閱讀 42,554評論 0 289
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎,沒想到半個月后,有當地人在樹林里發現了一具尸體,經...
    沈念sama閱讀 49,106評論 1 335
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 40,918評論 3 356
  • 正文 我和宋清朗相戀三年,在試婚紗的時候發現自己被綠了。 大學時的朋友給我發了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點故事閱讀 43,093評論 1 371
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡,死狀恐怖,靈堂內的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 38,648評論 5 362
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站,受9級特大地震影響,放射性物質發生泄漏。R本人自食惡果不足惜,卻給世界環境...
    茶點故事閱讀 44,342評論 3 347
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧,春花似錦、人聲如沸。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 34,755評論 0 28
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽。三九已至,卻和暖如春,著一層夾襖步出監牢的瞬間,已是汗流浹背。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 36,009評論 1 289
  • 我被黑心中介騙來泰國打工, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 51,839評論 3 395
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長得像,于是被迫代替她去往敵國和親。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子,可洞房花燭夜當晚...
    茶點故事閱讀 48,107評論 2 375

推薦閱讀更多精彩內容