String數據庫(https://string-db.org/)是一個搜尋蛋白質之間相互作用的數據庫。該數據庫可應用于2031個物種,包含960萬種蛋白和1380萬中蛋白質之間的相互作用。它除了包含有實驗數據、從PubMed摘要中挖掘的結果和綜合其他數據庫數據外,還有利用生物信息學的方法預測的結果。研究蛋白之間的相互作用網絡,有助于挖掘核心的調控基因。String數據庫目前更新到Version 11
1.多個基因間的互作:
輸入一個要查看的基因list
提交后得到蛋白互作的圖:
下面可以按需要的通路進行提取和最后的圖片導出:
2.單個基因的互作網絡
輸入單個基因名字提交即可。
歡迎關注~