STRING||蛋白互作數據庫在線分析基因互作網絡(PPI)

String數據庫(https://string-db.org/)是一個搜尋蛋白質之間相互作用的數據庫。該數據庫可應用于2031個物種,包含960萬種蛋白和1380萬中蛋白質之間的相互作用。它除了包含有實驗數據、從PubMed摘要中挖掘的結果和綜合其他數據庫數據外,還有利用生物信息學的方法預測的結果。研究蛋白之間的相互作用網絡,有助于挖掘核心的調控基因。String數據庫目前更新到Version 11

1.多個基因間的互作:

輸入一個要查看的基因list



提交后得到蛋白互作的圖:



下面可以按需要的通路進行提取和最后的圖片導出:

2.單個基因的互作網絡

輸入單個基因名字提交即可。


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參考:https://www.omicsclass.com/article/1126

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