發表雜志：Journal of Cellular and Molecluar Medicine
PMID：33215860
知識點
- HCCDB：包含15個常見的肝癌數據集
- p-EMT：partial epithelial mesenchymal transition 部分EMT，是EMT的中間狀態
科學問題
轉移性細胞癌表達一定量的E-cadherin，而處于p-EMT狀態的癌細胞具有強烈的趨勢適應轉移環境，具有更高的轉移風險。探討p-EMT相關基因與肝癌的關系。
整體思路
結果
1.mRNA周邊
1.1 表達（N vs T）
Fig.1
1.2 預后
Fig.2
1.3富集分析
Fig.3
1.4 突變+PPI
Fig.4
2.ceRNA網絡構建
2.1 miRNA
Fig.5
2.2 lncRNA
Fig.6
3.臨床樣本驗證
Fig.7
感悟：
- 整體思路比較清晰，圍繞p-EMT相關基因的周邊（表達、預后、突變和PPI），再加上ceRNA網絡構建，和臨床樣本驗證，相對思路比較完整。
- 亮點：p-EMT
參考鏈接：
Comprehensive analysis of partial epithelial mesenchymal transition-related genes in hepatocellular carcinoma
