單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫整理

一、human 和mouse的單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫

人鼠單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫，比較全面，數(shù)據(jù)庫里面也有cell type Marker

界面不是那么好用，數(shù)據(jù)應(yīng)該含有挺多物種的，也包括人和小鼠的

歐洲生物信息學(xué)中心，一共有 9 species, 52 studies, 61,073 assays。含有常用的物種，比如果蠅，斑馬魚，小鼠，大鼠，當(dāng)然還有人的，但是物種的數(shù)據(jù)量不大。

人和小鼠的數(shù)據(jù)庫

小鼠的數(shù)據(jù)庫

二、celltype 所對(duì)應(yīng)的細(xì)胞類型

  • 1.CellMarker - 總結(jié)了目前的celltype對(duì)應(yīng)的marker，同時(shí)給出了數(shù)據(jù)的文獻(xiàn)鏈接。
  • 2.signatureDB - B cell數(shù)據(jù)庫

參考：
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組聚類后的細(xì)胞類群如何查找數(shù)據(jù)庫來定義
單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫匯總

作者：YiyiLearn
鏈接：http://www.lxweimin.com/p/8b118d18d3e1

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