生物信息從零起步

? ? ? ?初次接觸生物信息還是在09年。那時候就覺得這是個很復雜很的技能。不過還是不了解具體的研究內容。認為做DNA,RNA,蛋白序列的比對就是生物信息的功能,真的是太孤陋寡聞了。
? ? ? ? 12年開始研究生生涯,最初也沒有接觸過NGS的東西,知道這個很高深,高深在哪里也不知道。知道14年初,自己的課題涉及到RNA-seq才開始了解這個技術的真正的目的。從測序原理,到測序建庫,測序能得到的數據開始慢慢學習。
? ? ? ? 15年開始,從事單細胞RNA-seq的實驗,實驗室沒有人做過這個方向,自己慢慢研究不同單細胞方法之間的優劣,不同方法的成本,實驗操作難度等等。一開始也只是和公司合作,將單細胞文庫構建好給公司,當時測序加數據的初步分析(到FPKM)公司收費要1000+,面對大量的樣品,發現分析成了最大的成本消耗。所以分析成了心病。每一個分析,其實有些真的很簡單,但是自己不會操作,只能依附于公司的進度,這個真的很頭疼。而且公司不知道你想要的結果,會無形之中錯過很多有用的信息。
? ? ? ? 在濕實驗的學習中,因為操作單細胞測序。針對微量樣品的實驗操作得心應手。慢慢的自己去研究不同測序的建庫方式,以最小的成本對單細胞和微量細胞進行了RNA-seq,ATAC-seq,RRBS,WGBS,HiC的建庫。令人尷尬的事出現了,數據全部躺在了硬盤里。面對這一現狀,需要改變。

? ? ? ?目前已經在生殖中心上班,留給自己的時間真的很少,再不學習真的就跟不上了。咬咬牙,配了一個小的服務器,跟著大伙兒一起前進。希望這條路上可以走的遠些。

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