? ? ?提到非編碼RNA,大家最熟悉的就是miRNA, miRNA靶基因研究,miRNA-lncRNA研究等等。小編最近發(fā)現(xiàn)了一個(gè)miRNA的新研究:A-to-I edited miRNA。雖然它不是剛出現(xiàn),但我想還是有很多人跟我一樣初次遇見它
? ? A-to-I是adenosine-to-inosine (腺苷-肌苷)的縮寫。A-to-I 是廣泛存在于人類中的一種RNA編輯方式,其機(jī)制是腺苷脫氨酶(ADARs)結(jié)合RNA分子的雙鏈區(qū)域,將腺苷脫氨成肌苷。肌苷在細(xì)胞內(nèi)會(huì)被識(shí)別為鳥苷,導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄本中的非同義密碼子變化以及產(chǎn)生選擇性剪接。這種方式發(fā)生于轉(zhuǎn)錄后水平,不影響DNA序列。RNA-Seq的出現(xiàn)(與基因組比對)使得大量RNA編輯位點(diǎn)被識(shí)別,包括A-to-I編輯位點(diǎn)。目前,廣泛使用的A-to-I編輯位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫是RNA編輯數(shù)據(jù)庫(DARNED,http://darned.ucc.ie)。
? ? 言歸正傳,我們回到A-to-I edited miRNA。發(fā)生在miRNA序列上的A-to-I editing 會(huì)影響miRNA的靶向性并破壞其成熟,從而影響其功能發(fā)揮,包括其在癌組織細(xì)胞中的表達(dá)和功能。下面以miR-379-5p為例,介紹A-to-I edited miRNA在癌癥中的功能改變。在癌癥中存在著wild-type miR-379-5p和A-to-I edited miR-379-5p。
A-to-I edited miR-379-5p在結(jié)腸癌,頭頸癌,肺癌等7種癌組織中的表達(dá)水平均低于正常組織。
而生存分析表明高水平A-to-I edited miR-379-5p能夠延長肺癌和腎癌患者的無病生存期。
A-to-I editing同樣引起了miR-379-5p靶基因的改變,wild-type miR-379-5p的靶基因是PTK2, 而A-to-I edited miR-379-5p則靶作用于CD97。
功能分析表明A-to-I edited miR-379-5p可通過靶作用于CD97介導(dǎo)癌細(xì)胞凋亡,從而發(fā)揮抑癌作用。
看完我的介紹,大家是不是都對A-to-I edited miRNA產(chǎn)生了濃厚的興趣呢?
參考文獻(xiàn):