常用繪圖 分析軟件

1、韋恩圖 Venn?Draw Venn Diagram (ugent.be)

2、STRING網(wǎng)站(STRING: functional protein association networks (string-db.org))-PPI互作網(wǎng)絡(luò)。但一般不用STRING網(wǎng)站做的圖,用STRING網(wǎng)站下載的tsv文件加載到cytoscope網(wǎng)站做分析.

3、cytoscope軟件-PPI作圖及分析。可以設(shè)置不同的顏色、形狀、字體大小等。APPs-MCODE,可以找出互作網(wǎng)絡(luò)中主要的Cluster。CytoHubba可以篩選出自定義數(shù)目的Hub基因。

4、DAVID網(wǎng)站-GO和KEGG分析,只能得到數(shù)據(jù)信息,無法作圖

5、GEPIA網(wǎng)站-基因表達(dá)量和預(yù)后分析,但是預(yù)后分析一般用Kaplan-Meier Plotter。

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