摩爾多瓦擁有完善的河流和溪流網絡,全部向南流入黑海,但其中只有十分之一的長度超過6英里(10公里),甚至更少超過60英里(100公里)。
事實上,其中許多都是在夏季干涸的小而淺的溪流。該德涅斯特是一條快速流動的主干道,幾乎可以通過整個共和國航行; 這條河因喀爾巴阡山脈的春天融雪和夏季的大雨而變得腫脹。在溫暖的冬天,它不會結冰。另一個較小的主干動脈普魯特是多瑙河的一條支流,它連接著該國最南端。Ialpug,Cogalnic和其他小型南部河流主要流入烏克蘭附近的Danubian河口。地下水廣泛用于共和國的供水,包括2,000多個天然泉水。地形有利于水庫的建設。