Metascape網站（http://metascape.org ）是一個能對基因或蛋白質列表進行注釋和富集等分析的在線工具，除了傳統的GO注釋和富集之外還提供的蛋白質互作分析結果，網站基本維持每月更新，確保分析結果及時準確，而用戶只需要輸入需要分析的基因列表即可完成一鍵式分析，極大方便了沒有編程基礎的生物科研工作者。
Metascape的使用非常簡單，只需要在對應的位置輸入基因或者蛋白列表（見下圖），可以直接粘貼也可以導入列表文件，并且網站頁面給出了各種案例文件的格式。目前網站接受多種形式的id，包括Entrez Gene ID，RefSeq (RNA and Proteins)， Gene Symbol and aliases，Ensembl (Gene, Transcript, Protein)，UCSC，UniProt。
用戶輸入需要分析的基因并提交，網站會對提交的基因id進行識別鑒定，之后可以選擇分析方式，Express Analysis 包含了常規的分析內容，可以一鍵式獲得分析結果，Custom Analysis 可以對需要分析的項目參數等進行設置，之后再進行分析獲取結果，此處以Custom Analysis繼續進行介紹。
Custom Analysis 界面會要求設置相關選項，以下圖富集設置為例，需要設置富集的相關閾值，要分析的項目(不同的功能選擇)，背景基因（Background）等等，設置好符合自身要求的選項，開始進行分析。
完成分析后可以選擇進入報告頁面，各部分分析結果將以圖片形式直觀顯示，同時可以進行保存。例如：
1、分析完成界面：
2、 報告界面—右上角可以保存所有結果的壓縮包：
3、 GO分析結果—可以保存為cys,pdf，web等格式：
4、蛋白質互作分析結果
Metascape除了提供單一基因列表的分析之外，還可以進行多列基因分析，具體可以通過網站使用手冊快速學習。總而言之，簡單又好用的網站果斷收藏！
更多生物信息課程：
1. 文章越來越難發？是你沒發現新思路，基因家族分析發2-4分文章簡單快速，學習鏈接：基因家族分析實操課程、基因家族文獻思路解讀
2. 轉錄組數據理解不深入？圖表看不懂？點擊鏈接學習深入解讀數據結果文件，學習鏈接：轉錄組（有參）結果解讀；轉錄組（無參）結果解讀
3. 轉錄組數據深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章檔次，學習鏈接：WGCNA-加權基因共表達網絡分析
4. 轉錄組數據怎么挖掘？學習鏈接：轉錄組標準分析后的數據挖掘、轉錄組文獻解讀
5.微生物16S/ITS/18S分析原理及結果解讀、OTU網絡圖繪制、cytoscape與網絡圖繪制課程
6. 生物信息入門到精通必修基礎課，學習鏈接：linux系統使用、perl入門到精通、perl語言高級、R語言畫圖
7. 醫學相關數據挖掘課程，不用做實驗也能發文章，學習鏈接：TCGA-差異基因分析、GEO芯片數據挖掘、GSEA富集分析課程、TCGA臨床數據生存分析、TCGA-轉錄因子分析、TCGA-ceRNA調控網絡分析
8.其他課程鏈接：二代測序轉錄組數據自主分析、NCBI數據上傳、二代測序數據解讀。
