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options("repos" = c(CRAN="http://mirrors.cloud.tencent.com/CRAN/"))
創(chuàng)建ggplot圖形
繪圖模板：
ggplot(data = <DATA>) +
<GEOM_FUNCTION>(mapping = aes(<MAPPINGS>))
ggplot()函數(shù)創(chuàng)建一個坐標系，可以在上面添加圖層。第一個data參數(shù)表示要使用的數(shù)據(jù)集。geom_point()函數(shù)表示向圖中添加一個點層，也就是創(chuàng)建一個散點圖，ggplot2中包含多種幾何對象作圖函數(shù)，每種函數(shù)都可以向初始坐標系中添加不同類型的圖層。每個幾何對象函數(shù)都有一個mapping參數(shù)，這個參數(shù)定義了如何將數(shù)據(jù)集中的變量映射為圖形屬性。mapping參數(shù)總是和aes()函數(shù)成對出現(xiàn)，aes()函數(shù)的x參數(shù)和y參數(shù)分類指定映射到x軸的變量與映射到y(tǒng)軸的變量，它會在data參數(shù)中尋找所指定的映射變量。

圖形屬性映射
圖形屬性是圖中對象的可視化屬性，包括數(shù)據(jù)點的大小，形狀，顏色等，通過改變圖形屬性的值能以不同的方式來顯示數(shù)據(jù)點。例如：向二維散點圖中添加第三個變量，將其映射為圖形屬性。
color屬性

size屬性

alpha屬性

shape屬性
注：只能處理6個一類的分類變量，多出的變量值不會顯示在圖形中。

pch，fill參數(shù)
pch參數(shù)用于控制點的形狀，有如下形狀：

有的形狀相同比如0，15，22都是正方形。形狀之間的區(qū)別在于其顏色不同，而控制其顏色的參數(shù)有color和fill兩個?？招男螤睿?-14）的邊界顏色由color決定；實行形狀（15-20）的填充顏色由color決定；填充形狀（21-24）的邊界顏色由color決定，填充顏色由fill決定。

分面
添加額外變量的一種方法是使用圖形屬性，另一種方法是將圖形分割成多個分面，即可以顯示數(shù)據(jù)子集的子圖。
facet_wrap()函數(shù)
facet_wrap()函數(shù)可以用于對單個變量進行分面，傳遞給facet_wrap()的變量應該是離散型的。

facet_grid()函數(shù)
facet_grid()函數(shù)可以對兩個變量進行分面，這個函數(shù)第一個參數(shù)也是一個公式，但該公式包含由~隔開的兩個變量名。如果不想在行或列的維度進行分面，你可以使用 . 來代替變量名，例如 + facet_grid(. ~cyl)。

幾何對象
幾何對象是圖中用來表示數(shù)據(jù)的幾何圖形對象。我們經(jīng)常根據(jù)圖中使用的幾何對象類型l唉描述相應的圖。想要改變圖中的幾何對象，需要修改添加在ggplot()函數(shù)中的幾何對象函數(shù)。
geom_point()

geom_smoonth()

ggplot2中的每個幾何對象函數(shù)都有一個mapping參數(shù)，但是不是所有的圖形屬性都適合每種幾何對象。比如可以設(shè)置點的形狀，不能設(shè)置線的形狀，但是可以設(shè)置線的線型。
geom_smooth() 函數(shù)可以按照不同的線型繪制出不同的曲線，每條曲線對應映射到線型的變量的一個唯一值：

平滑曲線＋散點圖：

gplot2 提供了 30 多種幾何對象，其擴展包甚至提供了更多（可以在 https://www.ggplot2-exts.org 查看更多樣例）。如果想全面地了解這些對象，最好的方式是學習 ggplot2 速查表（參見 http://rstudio.com/cheatsheets）。如果想掌握更多關(guān)于某個幾何對象的知識，那么可以使用幫助，如 ?geom_smooth。
group圖形屬性
和 geom_smooth() 一樣，很多幾何對象函數(shù)使用單個幾何對象來表示多行數(shù)據(jù)。你可以將這些幾何對象的 group 圖形屬性設(shè)置為一個分類變量，這樣 ggplot2 就會為這個分類變量的每個唯一值繪制一個獨立的幾何對象。這是一個非常方便的屬性，因為按照圖形屬性的這種分組不用添加圖例，也不用為幾何對象添加區(qū)分特征：（沒有特色，不建議使用）

多個幾何對象
要想在同一張圖中顯示多個幾何對象，可以向 ggplot() 函數(shù)中添加多個幾何對象函數(shù)：

添加多個幾何對象函數(shù)的方法會使代碼產(chǎn)生重復，如果需要修改的時候工作量會更大且容易出錯，避免這種重復的方法是將一組映射傳遞給 ggplot() 函數(shù)。 ggplot2 會將這些映射作為全局映射應用到圖中的每個幾何對象中。

如果將映射放在幾何對象函數(shù)中，那么 ggplot2 會將其看作這個圖層的局部映射，它將使用這些映射擴展或覆蓋全局映射，但僅對該圖層有效。

同理，也可以為不同的圖層指定不同的數(shù)據(jù)。se=TRUE顯示置信區(qū)間，F(xiàn)ALSE不顯示置信區(qū)間。

統(tǒng)計變換
? 條形圖、直方圖和頻率多邊形圖可以對數(shù)據(jù)進行分箱，然后繪制出分箱數(shù)量和落在每個分箱的數(shù)據(jù)點的數(shù)量。
? 平滑曲線會為數(shù)據(jù)擬合一個模型，然后繪制出模型預測值。
? 箱線圖可以計算出數(shù)據(jù)分布的多種摘要統(tǒng)計量，并顯示一個特殊形式的箱體。
繪圖時用來計算新數(shù)據(jù)的算法稱為 stat（statistical transformation， 統(tǒng)計變換）。
下圖描述了geom_bar() 函數(shù)的統(tǒng)計變換過程：

每個幾何對象函數(shù)都有一個默認統(tǒng)計變換，每個統(tǒng)計變換函數(shù)都有一個默認幾何對象，因此幾何對象函數(shù)和統(tǒng)計變換函數(shù)可以互換使用。例如，可以使用 stat_count()替換 geom_bar() 來重新生成前面那張圖：

stat_summary()
stat_summary()函數(shù)可以對計算得出的某些摘要進行強調(diào)。

• fun.y 表示指定對y的匯總函數(shù)，同樣是輸入數(shù)字向量，返回單個數(shù)字，這里的y通常會被分組，匯總后是每組返回1個數(shù)字
• fun.ymin 表示取y的最小值，輸入數(shù)字向量，每組返回1個數(shù)字

• fun.ymax 表示取y的最大值，輸入數(shù)字向量，每組返回1個數(shù)字

  
  

位置調(diào)整
fill圖形屬性可以用于為條形圖上色

position參數(shù)
position參數(shù)的功能是對圖形進行位置調(diào)整，可選參數(shù)：identity，fill，dodge，jitter等。
identity
當不對position進行指定時，默認為identity，采用堆疊式:

fill
百分式：

dodge
分離式：

jitter
過繪制：繪制散點圖是，當繪制的點很多時，可能會出現(xiàn)同一個位置出現(xiàn)點重復而導致繪制出來的三點數(shù)量與真實的點的數(shù)量不匹配的情況。

結(jié)果過繪制的問題可以通過講position設(shè)置為jitter，即添加擾動解決：

因為這種操作的用處非常大，所以 ggplot2 提供了 geom_point(position = "jitter") 的一種快速實現(xiàn)方式： geom_jitter()。

坐標系
坐標系可能是 ggplot2 中最復雜的部分。默認的坐標系是笛卡兒直角坐標系，可以通過其獨立作用的 x 坐標和 y 坐標找到每個數(shù)據(jù)點。
coord_flip()
coord_flip() 函數(shù)可以交換 x 軸和 y 軸。該方法對于x軸標簽過于密集而導致相互重合用較好的使用價值。

coord_quickmap()
coord_quickmap() 函數(shù)可以為地圖設(shè)置合適的縱橫比。當使用 ggplot2 繪制空間數(shù)據(jù)時，
這個函數(shù)特別重要（遺憾的是本書不涉及空間數(shù)據(jù)）：

coord_polar()
coord_polar() 函數(shù)使用極坐標系。

圖形分層語法
ggplot(data = <DATA>) + #數(shù)據(jù)集
<GEOM_FUNCTION>( #幾何對象
mapping = aes(<MAPPINGS>), #映射
stat = <STAT>, #統(tǒng)計變換
position = <POSITION> #位置調(diào)整
) +
<COORDINATE_FUNCTION> + #坐標系
<FACET_FUNCTION> #分面
ggplot2使用隨記：
theme(panel.grid =element_blank()) + ## 刪去網(wǎng)格線
theme(axis.text = element_blank()) ## 刪去所有刻度標簽
theme(axis.text.y = element_blank()) ## 設(shè)置 axis.text.y 則只刪去 Y 軸的刻度標簽，X 軸同理。
scale_x_discrete(position = "top") #設(shè)置x軸的位置在頂部