Linux 發行版的選擇
縱觀國內生信公司，所有的生信分析平臺都是Linux操作系統環境，我選擇了 Arch Linux 作為我的工作和學習環境。
- Arch Linux 相比于 Ubuntu 輕量、簡潔；
- Arch Linux 下軟件包眾多，安裝方便簡潔，一條命令搞定： pacman -s software；
- No zuo no die I must try !
注意：以下工作開始之前最好對電腦硬盤及可移動 U 盤進行數據備份！
準備工作：
- 下載 Arch Linux 系統鏡像 ：點擊 Arch Linux 進入下載頁。
- 刻錄啟動 U 盤
Windows 下推薦使用 USBwriter，點擊百度網盤下載。下載后按照軟件提示載入 iso 鏡像文件選則正確的 U 盤進行系統刻錄。
Linux 系統環境下推薦使用 dd 命令進行刻錄。
sudo fdisk -l # 1. 查看磁盤情況，確定 U 盤
? ~ sudo fdisk -l
Disk /dev/sda: 223.6 GiB, 240057409536 bytes, 468862128 sectors
Units: sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 4096 bytes
I/O size (minimum/optimal): 4096 bytes / 4096 bytes
Disklabel type: dos
Disk identifier: 0x9292aa93
Device Boot Start End Sectors Size Id Type
/dev/sda1 * 2048 976895 974848 476M 83 Linux
/dev/sda2 976896 16601087 15624192 7.5G 82 Linux swap / Solaris
/dev/sda3 16601088 175894527 159293440 76G 83 Linux
/dev/sda4 175894528 468860927 292966400 139.7G 83 Linux
Disk /dev/sdb: 3.8 GiB, 4009754624 bytes, 7831552 sectors
Units: sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O size (minimum/optimal): 512 bytes / 512 bytes
Disklabel type: dos
Disk identifier: 0x2eec075d
Device Boot Start End Sectors Size Id Type
/dev/sdb1 * 0 1775615 1775616 867M 0 Empty
/dev/sdb2 172 131243 131072 64M ef EFI (FAT-12/16/32)
sudo umount /dev/sdb1 # 2. 卸載 U 盤
sudo dd if=/home/liupeng/Downloads/archlinux-2017.01.01-dual.iso of=/dev/sdb # 3. 刻錄系統啟動 U 盤
注：這三個命令需要管理員權限.
U盤刻錄完畢后進行系統安裝；
系統安裝
開始前的一點建議：
- 數據備份！數據備份！數據備份！
- 提前分區，建議使用圖形化分區工具提前進行硬盤分區
- 連接不需要登錄驗證的有線網
具體安裝步驟參考 Arch Linux Wiki 頁面指導進行安裝；
# 1. 檢查系統啟動模式，如果可以列出文件則是 UEFI 啟動模式否則是 MRB 啟動模式
ls /sys/firmware/efi/efivars
# 2. 設置默認鍵盤布局（保持默認就好）
loadkeys us
# 3. 驗證網絡, 確保網絡正常
ping -c www.baidu.com
# 4. 更新系統時間，確保系統時間正常
timedatectl set-ntp true
# 5. 格式化并掛載分區, 我已經提前分好了三個分區及一個交換分區。
mkfs.ext4 /dev/sda1 # 格式化第一分區，分區文件系統為 ext4
mkfs.ext4 /dev/sda3 # 格式化第三分區，分區文件系統為 ext4
mkfs.ext4 /dev/sda4 # 格式化第四分區，分區文件系統為 ext4
mount /dev/sda1 /mnt # 將根目錄 / 掛載在第一分區
mkdir /mnt/boot # 創建 boot 目錄
mkdir /mnt/home # 創建 home 目錄
mount /dev/sda3 /mnt/boot # 將 boot 目錄 /boot 掛載在第三分區
mount /dev/sda4 /mnt/home # 將 home 目錄 /home 掛載在第四分區
swapon /dev/sda2 # 激活第三分區為交換分區
我的電腦配置如下圖；
預先設定的各個分區大小為 ：
/boot 500 M
/ 70 G
swap 8 G
/home 剩余空間
開始系統安裝前先配置軟件源，如果在國內的話建議選擇 163 的源，下載速度較快：
vi /etc/pacman.d/mirrorlist # 將國內的源放在前面幾行
## Score: 3.1, China
Server = http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/archlinux/$repo/os/$arch
## Score: 5.0, China
Server = http://mirrors.ustc.edu.cn/archlinux/$repo/os/$arch
## Score: 13.5, China
Server = http://mirrors.163.com/archlinux/$repo/os/$arch
## [archlinuxcn]
Server = http://mirrors.163.com/archlinux-cn/$arch
## Score: 3.5, China
Server = http://mirrors.zju.edu.cn/archlinux/$repo/os/$arch
## Score: 5.4, China
Server = http://mirrors.xjtu.edu.cn/archlinux/$repo/os/$arch
## Score: 6.9, China
Server = http://mirror.lzu.edu.cn/archlinux/$repo/os/$arch
# 6. 安裝基礎系統
pacstrap -i /mnt base base-devel
網速良好的情況下大約10-30分鐘左右安裝完成！然后配置系統！這一部分要小心仔細了！
# 7. 生成 fstab 文件 (用 -U 或 -L 選項設置UUID 或卷標)
genfstab -U /mnt >> /mnt/etc/fstab # 生成 fstab 文件
cat /mnt/etc/fstab # 檢查查看 fstab 文件是否正常，文件內容是否與你的分區及掛載信息一致
# 8. 切換到新安裝好的系統
arch-chroot /mnt /bin/bash # 切換并使用 bash
# 9. 設置時區
ln -s /usr/share/zoneinfo/Asia/Shanghai /etc/localtime # 設置時區為東八區上海
# 10. 設置時間標準為 UTC，并調整時間漂移:
hwclock --systohc --utc
# 11. 設置本地化文件
vi /etc/locale.gen
en_US.UTF-8 UTF-8
zh_CN.UTF-8 UTF-8
zh_TW.UTF-8 UTF-8
# 12. 執行locale-gen以生成locale訊息
locale-gen
# 13. 創建 locale.conf 并提交您的本地化選項
echo LANG=en_US.UTF-8 > /etc/locale.conf # 將系統 locale 設置為 en_US.UTF-8，系統的 Log 就會用英文顯示，這樣更容易問題的判斷和處理。
# 14. 設置主機名
echo liupeng > /etc/hostname
# 15. 將主機名添加進 hosts 信息
vi /etc/hosts
127.0.0.1 localhost.localdomain localhost
::1 localhost.localdomain localhost
127.0.1.1 liupeng.localdomain liupeng
# 16. 設置 root 密碼:
passwd
# 17. 安裝引導程序,推薦安裝 GRUB 適用于 BIOS 系統與 UEFI 系統。
# 以下命令適用于 Bios 系統，UEFI 系統請自行 Wiki
grub-install --target=i386-pc /dev/sda
grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg
# 18. 安裝完成重啟進入新系統
exit # 退出 chroot
umount -R /mnt # 卸載掛載的分區
reboot # 重啟系統，重啟之前記得拔掉 U 盤
至此Arch Linux 就算安裝完成了，但是重啟之后會發現系統是黑乎乎冰冷冷的字符界面，這就需要后續桌面環境的安裝與配置了！
預知后事如何，請聽下回分解！
