根據產業投資基金的法律實體的不同，產業投資基金的組織形式可分為公司型、契約型和有限合伙型。
1公司型
主體：公司型產業投資基金是依據公司法成立的法人實體，通過募集股份將集中起來的資金進行投資，政府出資以公司股東身份的形式存在。
決策：公司型基金有著與一般公司相類似的治理結構，基金很大一部分決策權掌握在投資人組成的董事會，投資人的知情權和參與權較大。
投資：公司型產業基金的結構在資本運作及項目選擇上受到的限制較少，具有較大的靈活性。
管理：在基金管理人選擇上，既可以由基金公司自行管理，也可以委托其他機構進行管理。
2契約型
主體：契約型產業投資基金一般采用資管計劃、信托和私募基金的形式，政府出資往往作為認購方出現。
特色：契約型基金是一種資金的集合，不具有法人地位，在投資未上市企業的股權時，無法直接作為股東進行工商登記的，一般只能以基金管理人的名義認購項目公司股份。
決策：投資者作為信托、資管等契約的當事人和產業投資基金的受益者，一般不參與管理決策。
管理：契約型產業投資基金不是法人，必須委托基金管理公司管理運作基金資產，所有權和經營權分離，有利于產業投資基金進行長期穩定的運作。
3有限合伙型
主體：有限合伙型產業基金由普通合伙人（GeneralPartner，GP）和有限合伙人（LimitedPartner，LP）組成。
普通合伙人通常是資深的基金管理人或運營管理人，負責有限合伙基金的投資，一般在有限合伙基金的資本中占有很小的份額。而有限合伙人主要是機構投資者，他們是投資基金的資金主要提供者，政府出資以有限合伙人的形式出現。
投資：投資方向在合伙協議中約定，投資項目由投資決策委員會決定，投資決策委員會一般由普通合伙人、專家組成。
管理：通常情況下，有限合伙人實際上放棄了對有限合伙基金的控制權，只保留一定的監督權，將基金的運營交給普通合伙人負責。普通合伙人的報酬結構以利潤分成為主要形式。?
特色：典型的有限合伙型產業基金結構可分為三層：銀行、保險等低成本資金所構成的優先層，基金發起人資金所構成的劣后層，以及夾層資金所構成的中間層。優先層承擔最少風險，同時作為杠桿，提高了中間層和劣后層的收益。通過這種設計，有限合伙型產業基金在承擔合理風險的同時，能夠為投資者提供較高收益。
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