轉載地址 http://blog.csdn.net/lsshlsw/article/details/49155087
一. 運維
- Master掛掉,standby重啟也失效
Master默認使用512M內存,當集群中運行的任務特別多時,就會掛掉,原因是master會讀取每個task的event log日志去生成Spark ui,內存不足自然會OOM,可以在master的運行日志中看到,通過HA啟動的master自然也會因為這個原因失敗。
解決
增加Master的內存占用,在Master節點spark-env.sh
中設置:
export SPARK_DAEMON_MEMORY 10g # 根據你的實際情況
減少保存在Master內存中的作業信息
spark.ui.retainedJobs 500 # 默認都是1000spark.ui.retainedStages 500
- worker掛掉或假死
有時候我們還會在web ui中看到worker節點消失或處于dead狀態,在該節點運行的任務則會報各種 lost worker
的錯誤,引發原因和上述大體相同,worker內存中保存了大量的ui信息導致gc時失去和master之間的心跳。
解決
增加Master的內存占用,在Worker節點spark-env.sh
中設置:
export SPARK_DAEMON_MEMORY 2g # 根據你的實際情況
減少保存在Worker內存中的Driver,Executor信息
spark.worker.ui.retainedExecutors 200 # 默認都是1000spark.worker.ui.retainedDrivers 200
二. 運行錯誤
1.shuffle FetchFailedException
Spark Shuffle FetchFailedException解決方案
錯誤提示
missing output location
org.apache.spark.shuffle.MetadataFetchFailedException: Missing an output location for shuffle 0
shuffle fetch faild
org.apache.spark.shuffle.FetchFailedException:Failed to connect to spark047215/192.168.47.215:50268
當前的配置為每個executor使用1core,5GRAM,啟動了20個executor
解決
這種問題一般發生在有大量shuffle操作的時候,task不斷的failed,然后又重執行,一直循環下去,直到application失敗。
一般遇到這種問題提高executor內存即可,同時增加每個executor的cpu,這樣不會減少task并行度。
spark.executor.memory 15G
spark.executor.cores 3
spark.cores.max 21
啟動的execuote數量為:7個
execuoterNum = spark.cores.max/spark.executor.cores
每個executor的配置:
3core,15G RAM
消耗的內存資源為:105G RAM
15G*7=105G
可以發現使用的資源并沒有提升,但是同樣的任務原來的配置跑幾個小時還在卡著,改了配置后幾分鐘就能完成。
2.Executor&Task Lost
錯誤提示
executor lost
WARN TaskSetManager: Lost task 1.0 in stage 0.0 (TID 1, aa.local):ExecutorLostFailure (executor lost)
task lost
WARN TaskSetManager: Lost task 69.2 in stage 7.0 (TID 1145, 192.168.47.217):java.io.IOException: Connection from /192.168.47.217:55483 closed
各種timeout
java.util.concurrent.TimeoutException: Futures timed out after [120 second]ERROR TransportChannelHandler: Connection to /192.168.47.212:35409 has been quiet for 120000 ms while there are outstanding requests.Assuming connection is dead; please adjust spark.network.timeout if this is wrong
解決
由網絡或者gc引起,worker或executor沒有接收到executor或task的心跳反饋。 提高 spark.network.timeout
的值,根據情況改成300(5min)或更高。 默認為 120(120s),配置所有網絡傳輸的延時,如果沒有主動設置以下參數,默認覆蓋其屬性
spark.core.connection.ack.wait.timeout
spark.akka.timeout
spark.storage.blockManagerSlaveTimeoutMs
spark.shuffle.io.connectionTimeout
spark.rpc.askTimeout or spark.rpc.lookupTimeout
3.傾斜
錯誤提示
數據傾斜
任務傾斜 差距不大的幾個task,有的運行速度特別慢。
解決
大多數任務都完成了,還有那么一兩個任務怎么都跑不完或者跑的很慢,分為數據傾斜和task傾斜兩種。
數據傾斜 數據傾斜大多數情況是由于大量的無效數據引起,比如null或者”“,也有可能是一些異常數據,比如統計用戶登錄情況時,出現某用戶登錄過千萬次的情況,無效數據在計算前需要過濾掉。 數據處理有一個原則,多使用filter,這樣你真正需要分析的數據量就越少,處理速度就越快。
sqlContext.sql("...where col is not null and col != ''")
具體可參考: 解決spark中遇到的數據傾斜問題
任務傾斜 task傾斜原因比較多,網絡io,cpu,mem都有可能造成這個節點上的任務執行緩慢,可以去看該節點的性能監控來分析原因。以前遇到過同事在spark的一臺worker上跑R的任務導致該節點spark task運行緩慢。 或者可以開啟spark的推測機制,開啟推測機制后如果某一臺機器的幾個task特別慢,推測機制會將任務分配到其他機器執行,最后Spark會選取最快的作為最終結果。
spark.speculation true
spark.speculation.interval 100 - 檢測周期,單位毫秒;
spark.speculation.quantile 0.75 - 完成task的百分比時啟動推測
spark.speculation.multiplier 1.5 - 比其他的慢多少倍時啟動推測。
4.OOM
錯誤提示
堆內存溢出
java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space
解決
內存不夠,數據太多就會拋出OOM的Exeception,主要有driver OOM和executor OOM兩種
driver OOM 一般是使用了collect操作將所有executor的數據聚合到driver導致。盡量不要使用collect操作即可。
executor OOM 可以按下面的內存優化的方法增加code使用內存空間
增加executor內存總量,也就是說增加spark.executor.memory
的值
增加任務并行度(大任務就被分成小任務了),參考下面優化并行度的方法
5.task not serializable
錯誤提示
org.apache.spark.SparkException: Job aborted due to stage failure: Task not serializable: java.io.NotSerializableException: ...
解決
如果你在worker中調用了driver中定義的一些變量,Spark就會將這些變量傳遞給Worker,這些變量并沒有被序列化,所以就會看到如上提示的錯誤了。
val x = new X() //在driver中定義的變量dd.map{r => x.doSomething(r) }.collect //map中的代碼在worker(executor)中執行
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除了上文的map,還有filter,foreach,foreachPartition等操作,還有一個典型例子就是在foreachPartition中使用數據庫創建連接方法。這些變量沒有序列化導致的任務報錯。
下面提供三種解決方法:
將所有調用到的外部變量直接放入到以上所說的這些算子中,這種情況最好使用foreachPartition減少創建變量的消耗。
將需要使用的外部變量包括sparkConf
,SparkContext
,都用 @transent
進行注解,表示這些變量不需要被序列化
將外部變量放到某個class中對類進行序列化。
6.driver.maxResultSize太小
錯誤提示
Caused by: org.apache.spark.SparkException: Job aborted due to stage failure: Total size of serialized results of 374 tasks (1026.0 MB) is bigger than spark.driver.maxResultSize (1024.0 MB)
解決
spark.driver.maxResultSize默認大小為1G 每個Spark action(如collect)所有分區的序列化結果的總大小限制,簡而言之就是executor給driver返回的結果過大,報這個錯說明需要提高這個值或者避免使用類似的方法,比如countByValue,countByKey等。
將值調大即可
spark.driver.maxResultSize 2g
7.taskSet too large
錯誤提示
WARN TaskSetManager: Stage 198 contains a task of very large size (5953 KB). The maximum recommended task size is 100 KB.
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這個WARN可能還會導致ERROR
Caused by: java.lang.RuntimeException: Failed to commit taskCaused by: org.apache.spark.executor.CommitDeniedException: attempt_201603251514_0218_m_000245_0: Not committed because the driver did not authorize commit
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解決
如果你比較了解spark中的stage是如何劃分的,這個問題就比較簡單了。 一個Stage中包含的task過大,一般由于你的transform過程太長,因此driver給executor分發的task就會變的很大。 所以解決這個問題我們可以通過拆分stage解決。也就是在執行過程中調用cache.count
緩存一些中間數據從而切斷過長的stage。
- driver did not authorize commit
driver did not authorize commit - 環境報錯
driver節點內存不足 driver內存不足導致無法啟動application,將driver分配到內存足夠的機器上或減少driver-memory
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM warning: INFO:
os::commit_memory(0x0000000680000000, 4294967296, 0) failed; error=’Cannot allocate memory’ (errno=12)
hdfs空間不夠 hdfs空間不足,event_log無法寫入,所以 ListenerBus會報錯
,增加hdfs空間(刪除無用數據或增加節點)
Caused by: org.apache.hadoop.ipc.RemoteException(java.io.IOException): File /tmp/spark-history/app-20151228095652-0072.inprogress could only be replicated to 0 nodes instead of minReplication (=1)ERROR LiveListenerBus: Listener EventLoggingListener threw an exceptionjava.lang.reflect.InvocationTargetException
spark編譯包與Hadoop版本不一致 下載對應hadoop版本的spark包或自己編譯。
java.io.InvalidClassException: org.apache.spark.rdd.RDD; local class incompatible: stream classdesc serialVersionUID
driver機器端口使用過多 在一臺機器上沒有指定端口的情況下,提交了超過15個任務。
16/03/16 16:03:17 ERROR SparkUI: Failed to bind SparkUIjava.net.BindException: 地址已在使用: Service 'SparkUI' failed after 16 retries!
提交任務時指定app web ui端口號解決:
--conf spark.ui.port=xxxx
中文亂碼
使用write.csv等方法寫出到hdfs的文件,中文亂碼。JVM使用的字符集如果沒有指定,默認會使用系統的字符集,因為各個節點系統字符集并不都是UTF8導致,所以會出現這個問題。直接給JVM指定字符集即可。
spark-defaults.conf
spark.executor.extraJavaOptions -Dfile.encoding=UTF-8
三. 一些python錯誤
1.python版本過低
java.io.UIException: Cannot run program "python2.7": error=2,沒有那個文件或目錄
spark使用的Python版本為2.7,centOS默認python版本為2.6,升級即可。
2.python權限不夠
錯誤提示
部分節點上有錯誤提示
java.io.IOExeception: Cannot run program "python2.7": error=13, 權限不夠
解決
新加的節點運維裝2.7版本的python,python命令是正確的,python2.7卻無法調用,只要改改環境變量就好了。
3.pickle使用失敗
錯誤提示
TypeError: ('cinit() takes exactly 8 positional arguments (11 given)', <type 'sklearn.tree._tree.Tree'>, (10, array([1], dtype=int32), 1, <sklearn.tree._tree.RegressionCriterion object at 0x100077480>, 50.0, 2, 1, 0.1, 10, 1, <mtrand.RandomState object at 0x10a55da08>))
解決
該pickle文件是在0.17版本的scikit-learn下訓練出來的,有些機器裝的是0.14版本,版本不一致導致,升級可解決,記得將老版本數據清理干凈,否則會報各種Cannot import xxx
的錯誤。
4.python編碼錯誤
錯誤提示
UnicodeEncodeError: 'ascii' codec can't encode characters in position 0-1: ordinal not in range(128)
解決
方法1:
import sys reload(sys) sys.setdefaultencoding('utf-8')
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方法2:
//報錯str(u'中國')//不報錯str(u'中國'.encode('utf-8'))
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四. 一些優化
- 部分Executor不執行任務
有時候會發現部分executor并沒有在執行任務,為什么呢?
(1) 任務partition數過少, 要知道每個partition只會在一個task上執行任務。改變分區數,可以通過 repartition
方法,即使這樣,在 repartition
前還是要從數據源讀取數據,此時(讀入數據時)的并發度根據不同的數據源受到不同限制,常用的大概有以下幾種:
hdfs - block數就是partition數mysql - 按讀入時的分區規則分partitiones - 分區數即為 es 的 分片數(shard)
(2) 數據本地性的副作用
taskSetManager在分發任務之前會先計算數據本地性,優先級依次是:
process(同一個executor) -> node_local(同一個節點) -> rack_local(同一個機架) -> any(任何節點)
Spark會優先執行高優先級的任務,任務完成的速度很快(小于設置的spark.locality.wait時間),則數據本地性下一級別的任務則一直不會啟動,這就是Spark的延時調度機制。
舉個極端例子:運行一個count任務,如果數據全都堆積在某一臺節點上,那將只會有這臺機器在長期計算任務,集群中的其他機器則會處于等待狀態(等待本地性降級)而不執行任務,造成了大量的資源浪費。
判斷的公式為:
curTime – lastLaunchTime >= localityWaits(currentLocalityIndex)
其中 curTime
為系統當前時間,lastLaunchTime
為在某優先級下最后一次啟動task的時間
如果滿足這個條件則會進入下一個優先級的時間判斷,直到 any
,不滿足則分配當前優先級的任務。
數據本地性任務分配的源碼在 taskSetManager.Scala
。
如果存在大量executor處于等待狀態,可以降低以下參數的值(也可以設置為0),默認都是3s。
spark.locality.waitspark.locality.wait.processspark.locality.wait.nodespark.locality.wait.rack
當你數據本地性很差,可適當提高上述值,當然也可以直接在集群中對數據進行balance。
- spark task 連續重試失敗
有可能哪臺worker節點出現了故障,task執行失敗后會在該 executor
上不斷重試,達到最大重試次數后會導致整個 application
執行失敗,我們可以設置失敗黑名單(task在該節點運行失敗后會換節點重試),可以看到在源碼中默認設置的是 0
,
private val EXECUTOR_TASK_BLACKLIST_TIMEOUT = conf.getLong("spark.scheduler.executorTaskBlacklistTime", 0L)
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在 spark-default.sh
中設置
spark.scheduler.executorTaskBlacklistTime 30000
當 task
在該 executor
運行失敗后會在其它 executor
中啟動,同時此 executor
會進入黑名單30s(不會分發任務到該executor)。
- 內存
如果你的任務shuffle量特別大,同時rdd緩存比較少可以更改下面的參數進一步提高任務運行速度。
spark.storage.memoryFraction
- 分配給rdd緩存的比例,默認為0.6(60%),如果緩存的數據較少可以降低該值。 spark.shuffle.memoryFraction
- 分配給shuffle數據的內存比例,默認為0.2(20%) 剩下的20%內存空間則是分配給代碼生成對象等。
如果任務運行緩慢,jvm進行頻繁gc或者內存空間不足,或者可以降低上述的兩個值。 "spark.rdd.compress","true"
- 默認為false,壓縮序列化的RDD分區,消耗一些cpu減少空間的使用
- 并發
mysql讀取并發度優化
spark.default.parallelism
發生shuffle時的并行度,在standalone模式下的數量默認為core的個數,也可手動調整,數量設置太大會造成很多小任務,增加啟動任務的開銷,太小,運行大數據量的任務時速度緩慢。
spark.sql.shuffle.partitions
sql聚合操作(發生shuffle)時的并行度,默認為200,如果該值太小會導致OOM,executor丟失,任務執行時間過長的問題
相同的兩個任務: spark.sql.shuffle.partitions=300:
并行度300
spark.sql.shuffle.partitions=500:
并行度500
速度變快主要是大量的減少了gc的時間。
但是設置過大會造成性能惡化,過多的碎片task會造成大量無謂的啟動關閉task開銷,還有可能導致某些task hang住無法執行。
這里寫圖片描述
修改map階段并行度主要是在代碼中使用rdd.repartition(partitionNum)
來操作。 - shuffle
spark-sql join優化 map-side-join 關聯優化 - 磁盤
磁盤IO優化
7.序列化
kryo Serialization
8.數據本地性
Spark不同Cluster Manager下的數據本地性表現 spark讀取hdfs數據本地性異常
9.代碼
編寫Spark程序的幾個優化點