繪制scenic的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖

其實(shí)我想畫(huà)這張圖,是scenic分析后轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控圖。

image.png

出自健明大佬分享的教程 SCENIC轉(zhuǎn)錄因子分析結(jié)果的解讀

我記得小潔老師講過(guò)ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)有類似的圖。回去找了教程,看到ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和這個(gè)圖好像。長(zhǎng)這樣
image.png

遂打算先學(xué)會(huì)ceRNA這個(gè)圖,然后把數(shù)據(jù)遷移到scenic轉(zhuǎn)錄因子。

健明大佬給分享了cytoscape的教程。我知道是用cytoscape來(lái)畫(huà)的了,
看了ceRNA的輸入數(shù)據(jù)
有兩個(gè)文件
分別長(zhǎng)這樣
一個(gè)邊的文件。


image.png

一個(gè)節(jié)點(diǎn)文件。


image.png

開(kāi)始:
首先把邊的文件導(dǎo)入
image.png

就得到這個(gè)圖。這已經(jīng)有個(gè)基本輪廓。


image.png

美化一下。
把另一個(gè)文件導(dǎo)入


image.png

分別在style里面設(shè)置下形狀和顏色。
image.png

出圖如下:


edges.txt.png

后面可以繼續(xù)其他美化,這里就不演示了 。
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