其實(shí)我想畫(huà)這張圖，是scenic分析后轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控圖。
image.png
出自健明大佬分享的教程 SCENIC轉(zhuǎn)錄因子分析結(jié)果的解讀
我記得小潔老師講過(guò)ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)有類似的圖。回去找了教程，看到ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和這個(gè)圖好像。長(zhǎng)這樣
image.png
遂打算先學(xué)會(huì)ceRNA這個(gè)圖，然后把數(shù)據(jù)遷移到scenic轉(zhuǎn)錄因子。
健明大佬給分享了cytoscape的教程。我知道是用cytoscape來(lái)畫(huà)的了，
看了ceRNA的輸入數(shù)據(jù)
有兩個(gè)文件
分別長(zhǎng)這樣
一個(gè)邊的文件。
image.png
一個(gè)節(jié)點(diǎn)文件。
image.png
開(kāi)始：
首先把邊的文件導(dǎo)入
image.png
就得到這個(gè)圖。這已經(jīng)有個(gè)基本輪廓。
image.png
美化一下。
把另一個(gè)文件導(dǎo)入
image.png
分別在style里面設(shè)置下形狀和顏色。
image.png
出圖如下：
edges.txt.png
后面可以繼續(xù)其他美化，這里就不演示了 。
