介紹
本手冊介紹了用于圖像配準(zhǔn)的軟件包：elastix。該軟件由通常用于解決醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn)問題的算法集合組成。大部分代碼是基于the Insight Toolkit(ITK)。elastix的模塊化設(shè)計(jì)允許用戶為他的特定應(yīng)用快速測試和比較不同的配準(zhǔn)方法。命令行使用腳本簡化了大量數(shù)據(jù)集的處理。
1.1 手冊概要
在第二章中，對一些通用的圖像配準(zhǔn)理論做了寬泛的介紹。也介紹了配準(zhǔn)方法包含的不同組件。在第三章中，介紹說明了elastix用法。第四章介紹tansformix，一個(gè)伴隨elastix的程序。第五章給出了一個(gè)教程，包括基于作者經(jīng)驗(yàn)的許多建議。第六章介紹更高級的配準(zhǔn)主題。最后一章提供了有關(guān)設(shè)置源代碼的人的更多細(xì)節(jié)，提供了有關(guān)如何實(shí)現(xiàn)自己對elastix的添加的信息，并描述了將elastix用作庫而不是 一個(gè)命令行程序。在附錄A和B中給出了示例（變換）參數(shù)文件。 附錄D包含軟件許可證和免責(zé)聲明，其中elastix目前正在分發(fā)。
1.2 快速開始
- 從http://elastix.isi.uu.nl/download.php 下載elastix。 有關(guān)安裝的詳細(xì)信息，請參見第3.2節(jié)。 不要忘記訂閱彈性郵件列表，這是問題和公告的主要論壇。
- 請閱讀http://elastix.isi.uu.nl/about.php 和本手冊中有關(guān)該程序的一些基礎(chǔ)知識。
- 嘗試使用的例子。 它可以在網(wǎng)站的“關(guān)于”部分找到。 如果您沒有在計(jì)算機(jī)上運(yùn)行示例，請查看常規(guī)部分中的常見問題解答：http://elastix.isi.uu.nl/FAQ.php
- 如果您是第一個(gè)想知道的人的類型，請閱讀完整的手冊。
- 開始使用您自己的應(yīng)用程序。 如果您現(xiàn)在需要更多信息，現(xiàn)在可以開始閱讀本手冊。 您可以在第5章中找到有關(guān)調(diào)整參數(shù)的更多信息。所有可用參數(shù)的列表可以在http://elastix.isi.uu.nl/doxygen/pages.html 找到。還可以參考http://elastix.isi.uu.nl/wiki.php 中 的參數(shù)文件數(shù)據(jù)庫，了解許多示例參數(shù)文件。
- 當(dāng)您卡住時(shí)，請不要錯(cuò)過本手冊第5章的教程。 另外，再次看一下常見問題的FAQ。
- 當(dāng)您仍然卡住時(shí)，請不要猶豫，發(fā)送電子郵件到彈性郵件列表。 一般來說，你很快會(huì)得到一個(gè)答案。 要訂閱，請?jiān)L問http://lists.bigr.nl/mailman/listinfo/elastix。
1.3 致謝
本手冊的第一個(gè)版本是在作者在荷蘭烏得勒支的圖像科學(xué)研究所（ISI，http://www.isi.uu.nl） 工作時(shí)撰寫的。 我們感謝elastix的用戶，他們的問題和評論有助于改進(jìn)彈性的可用性和文檔。 具體來說，當(dāng)我們構(gòu)建第一個(gè)版本時(shí)，我們要感謝以下人員對本手冊進(jìn)行校對（部分）：Josien Pluim, Keelin Murphy, Martijn van der Bom, Sascha M¨unzing, Jeroen de Bresser, Bram van Ginneken, Kajo van der Marel, Adri¨enne Mendrik（沒有特定的順序）。 多年來，幾個(gè)用戶將他們的工作作為彈性材料的新組件，參見網(wǎng)站列表。
