在展示染色體信息時，如果想要重點展示其中某一段區(qū)域的信息，可以借助zooms來實現(xiàn)。zooms起到一個伸縮的功能，將原本的區(qū)域放大或者縮小。
配置文件寫法如下：
zooms由多個zoom構(gòu)成，每個zoom必須具備以下幾個參數(shù)
chr
start
end
-
scale
其中chr, start , end這三個參數(shù)指定需要縮放的染色體區(qū)域，scale指定需要縮放的倍數(shù)。
看一個具體的例子：
在上面的示意圖中，對染色體多處區(qū)域進行了縮放。其中對1號染色體上的部分區(qū)域進行了放大，對2號染色體上的部分區(qū)域進行了縮小。
1號染色體100-120Mb區(qū)域放大2倍，接下來的區(qū)域依次類推，分別放大了3倍， 4倍，5倍；對應(yīng)配置文件的寫法為
2號染色體100-120Mb 區(qū)域縮小為原來的0.5倍，接下來的區(qū)域依次類推，分別縮小為原來0.25， 0.1，0.25， 0.5；對應(yīng)配置文件的寫法為
在上述的例子中，需要縮放的區(qū)域之間沒有重疊，當(dāng)這些區(qū)域之間以后重疊時，重疊區(qū)的縮放比例以最高的為準(zhǔn)。比如下面的縮放比例
實際處理時會變成如下的縮放比例
對于沒有爭議的區(qū)域，就按照指定的比例縮放，對于指定了多個縮放比例的overlap區(qū)，以最大的數(shù)值作為最終的縮放比例。
在zoom相關(guān)參數(shù)中，還有兩個很特別的參數(shù)
smooth_distance
-
smooth_steps
寫法如下：
這兩個參數(shù)的作用是控制鄰近區(qū)域的縮放情況。不指定這兩個參數(shù)時，只有目標(biāo)區(qū)域會進行縮放；指定這兩個參數(shù)后，會對上下游區(qū)域進行縮放。
smooth_distance控制需要縮放的上下游區(qū)域的距離，2r代表是目標(biāo)區(qū)域的兩倍，由于目標(biāo)區(qū)域為120u到125u, 長度為5M,需要縮放的上下游區(qū)域就是2 X 5 = 10M，這些區(qū)域也需要方法scale倍數(shù)； smooth_steps控制上下游區(qū)域縮放的步數(shù)，上下游區(qū)域的縮放比例是一個線性增長的關(guān)系，在下面的示意圖中，可以看到，1號染色體目的區(qū)域上游的10M區(qū)域110-120, 也放大為原來的10倍，其縮放不是整個區(qū)域直接放大10倍，而是劃分成了10個子的區(qū)域，每個區(qū)域縮放比例逐漸遞增，有1.8遞增到9.2，總和加起來是原先的10倍。
對于zooms而言，其參數(shù)一共只有6個，具體的含義上文也給很給出了詳細的解釋。但是對于染色體的縮放，除了zooms之外，還有其他的參數(shù)也可以實現(xiàn)
1. 對整個染色體進行縮放
通過chromosomes_scale參數(shù)來實現(xiàn)，寫法如下
chromosomes_scale = hs1:0.2;hs2:0.2;hs3:0.2;hs8:5;hs9:5;hs10:5
hs1:0.2表示將1號染色體縮小為原來的0.2倍，對于每條染色體的縮放比例，采用分號分隔。
2. 對染色體部分區(qū)域進行縮放
寫法如下
chromosomes = hs1[a]:0-20;hs2[b]:0-20;hs1[c]:20-40;hs2[d]:20-40;hs1[e]:40-60;hs2[f]:40-60
chromosomes_scale = a:0.5;b:0.5;e:5;f:5
以hs1為例，在chromosomes中，指定了a, c, e3個區(qū)間，在chromosomes_scale中，對這3個區(qū)間進行了縮放。
