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CellChat 三部曲2：使用CellChat 對(duì)多個(gè)數(shù)據(jù)集細(xì)胞通訊進(jìn)行比較分析 加載所需的包[#load-the-required-libr...

CellChat三部曲1：使用CellChat對(duì)單個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行細(xì)胞間通訊分析 自從周運(yùn)來(lái)在簡(jiǎn)書寫了一篇cellchat的中文介紹教程，然后R包作...

Single cell RNA-seq analysis workshop 該系列課程由瑞典國(guó)家生物信息學(xué)基礎(chǔ)設(shè)施(NBIS) 負(fù)責(zé)設(shè)置，為瑞典...

下面的代碼復(fù)制粘貼即可運(yùn)行，超級(jí)簡(jiǎn)單，如果是你自己的數(shù)據(jù)，你只需同樣的模式做出來(lái) exprMat 表達(dá)矩陣，和cellInfo的臨床表型，就可以...

大家好呀！今天為大家解讀的是一篇于2021年1月17日發(fā)表于nature communications的文章，題目為Inference and ...

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1. 簡(jiǎn)介 SCENIC （single-cell regulatory network inference and clustering）是一...

其實(shí)我想畫這張圖，是scenic分析后轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控圖。 出自健明大佬分享的教程 我記得小潔老師講過(guò)ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)有類似的圖。回去找了教程，...

目前單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域用的比較多的細(xì)胞聚類方法大多是直接從基因表達(dá)矩陣推斷，但是對(duì)于多樣本合并分析，很多情況下會(huì)出現(xiàn)難以解決的批次效應(yīng)，例如：有些...