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生物數據庫部分合集
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singularity 安裝與使用
singularity 容器技術是一種以應用軟件為中心的虛擬化技術。以應用軟件為單元，將軟件及所有的依賴打包成容器鏡像，打包后的容器鏡像可直接拷...
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使用網頁工具將ensemble號批量轉換成基因名我們在做數據挖掘的時候，有時候遇到的數據，提供的基因名是ensemble號，人的話是ENSG開頭，比如ENSG00000141736，而我們寫文...
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如何獲取kegg通路的基因列表
如何獲取kegg通路的基因列表？相信很多人都有這個疑惑。 哪些時候需要知道通路的基因列表？舉兩個例子： 在找差異基因這一步，只想針對特定通路的基...
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基因組組裝和注釋流程 from ChatGPT
【202301】Q:write a genome assembly and annotation pipeline for each step ...
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BUSCO 做基因組評價Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO)是用于評估基因組組裝和注釋的完整性的工具...
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PlantCARE預測植物啟動子-順式作用元件啟動子 啟動子是RNA 聚合酶識別、結合和開始轉錄的一段DNA 序列，它含有RNA 聚合酶特異性結合和轉錄起始所需的保守序列，多數位于結構基因轉...
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重測序分析（1）軟件安裝
今天開啟重測序分析專題啦！懇請各位觀眾老爺點點關注！ 所有分析均在linux系統上完成整個重測序分析流程涉及到的軟件非常多，本節介紹重測序常用軟...
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iTAK：在線預測全基因組轉錄因子TF，轉錄調節因子TR與蛋白激酶PK前言 康奈爾大學，FeiLab的一個預測工具。 iTAK 是依賴于數據庫的用于從蛋白質或核苷酸序列中識別植物轉錄因子 (TF)、轉錄調節因子 (...
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GToTree做進化樹
How to get phylogenetic tree from kraken or bracken output file?[https:/...
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