一. 示例數(shù)據(jù)準備 下載：鏈接：https://pan.baidu.com/s/1_b8swSkWDqIHZi6UwKaspA提取碼：pll7 ...
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R 數(shù)據(jù)可視化 01 | 聚類熱圖 -
enrichplot||基因富集結(jié)果可視化解決方案enrichplot包實現(xiàn)了幾種可視化方法來幫助解釋富集結(jié)果。它支持從DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler...
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UCSCXenaShiny實現(xiàn)基因表達的Pancer(泛癌）展示UCSCXenaShiny包由我和幾位小伙伴共同開發(fā)，如果對您有幫助請致謝我們，并引用我們的R包，有什么問題也可以給我們反饋。網(wǎng)址為https:...
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從GEO數(shù)據(jù)下載到limma差異分析，再到topGO富集分析一個失敗案例，不要點進來 GSE2034 topGO 1. DEG 1.1 下載GEO數(shù)據(jù) 1.2 表達矩陣 before: after: 1....
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R語言GEO數(shù)據(jù)挖掘01-數(shù)據(jù)下載及提取表達矩陣
作者：白介素2 這一節(jié)的內(nèi)容包括應(yīng)用 GEOquery包下載芯片數(shù)據(jù)，提取表達矩陣，提取metadata信息。解決一個探針對應(yīng)多個基因的問題 G...
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R實戰(zhàn) | TCGA數(shù)據(jù)挖掘復(fù)現(xiàn)--BRCA篇本文寫于觀看生信技能樹公眾號（vx: biotrainee）的七步走純R代碼通過數(shù)據(jù)挖掘復(fù)現(xiàn)一篇實驗文章（第1到6步）[https://mp.w...
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R實戰(zhàn) | 用R也可以完成的RNA-Seq分析-5
本文將介紹RNA-seq基因富集分析的實戰(zhàn)代碼。原文地址：https://bioinformatics-core-shared-training...
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R實戰(zhàn) | 用R也可以完成的RNA-Seq分析-4Annotation and Visualisation of RNA-seq results 本文將介紹RNA-seq差異分析結(jié)果可視化的實戰(zhàn)...
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R實戰(zhàn) | 用R也可以完成的RNA-Seq分析-3Differential Expression of RNA-seq data 本文將要介紹的是在R中進行RNA-seq 數(shù)據(jù)基因表達差異分析的...
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R實戰(zhàn) | 用R也可以完成的RNA-Seq分析-2Pre-processing 本文將要介紹的是在R中進行RNA-seq 數(shù)據(jù)預(yù)處理的實戰(zhàn)代碼原文地址：https://bioinformatic...
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