0.準備輸入數據 可以是矩陣 行是一邊，列是一邊，矩陣正文的數字表示連接的強度。 可以是tidy數據框 一行是一個連接關系，第一列和第二列是要連...
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弦圖，管他中不中用，反正高大上 -
想自己搭建服務器，永久運行網站？一個 U 盤大小的樹莓派就夠了！
No.1 前言 由于本人在這段時候，看到了一個叫做樹莓派的東東，初步了解之后覺得很有意思，于是想把整個過程記錄下來。 No.2 樹莓派是什么？ ...
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使用IGV簡單繪制甲基化分布圖廢話不多說，直接簡單粗暴的開始吧 導入基因組 導入基因組文件：Genomes→load geome from file→選擇"reference...
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群體結構——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析，旨在利用降維的思想，把多指標轉...
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計算bam文件中比對上基因組的reads以及合并多個bam文件
參考文章：1.如何統計BAM文件中的reads數2.Samtools常用命令的總結 當你有很多個bam文件時，想知道這些bam文件里有多少個比對...
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序列比對后計算變異位點，有效位點，核苷酸多樣性variable sites informative sites nucleotide diversity 信息位點的定義：在兩個及以上分類單元...
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讀文章重復結果：使用DnaSp軟件計算核苷酸多態性Pi(nucleotide diversity)
葉綠體基因組的文章中通常會有一小部分內容是運用DnaSp軟件來進行核苷酸多態性π分析，斷斷續續看了也好長時間了，今天終于重復出了結果，簡單記錄自...
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根據vcf文件計算SNP密度并用circlize可視化結果參考 收集vcftools所有用法 命令 100000 是指定窗口長度--out 是輸出文件的前綴 使用R語言中的circlize包畫圖 參考 ...
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全基因組關聯分析（GWAS）學習筆記——3.1參考資料 https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial/ 全基因組關聯分析學習資料（GWAS tutoria...
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如何利用NR庫快速進行物種鑒定
作者：charon審稿：童蒙編輯：angelica 引言 在做基因或者蛋白質功能注釋的時候，NR數據庫包含非常重要的信息。但是有沒有人跟我一樣遇...
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