轉(zhuǎn)錄組測序目前主要有兩種形式，RNA-seq和microarry。這兩種技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)在GEO數(shù)據(jù)庫中都有很多，其中RNA-seq的數(shù)據(jù)大多是已經(jīng)注釋過的symbol為行名的...
發(fā)簡信
IP屬地：陜西
-
-
生信小白教程之Count轉(zhuǎn)TPM，F(xiàn)PKM相信很多科研工作者（不包括比我厲害的大佬們）在做轉(zhuǎn)錄組時，都是在公司做測序，然后數(shù)據(jù)也交給公司分析，又然后，期待做個差異分析，得出像下圖那么完美的熱圖。 然而，然而，，我們得...
-
定量免疫浸潤在單細胞研究中的應(yīng)用最近聽說定量免疫浸潤很火，于是我也報名參加了果子老師的課程，跑了幾個R包，你比如說xCell啊，GSVA啊，MCPcounter啊，ConsensusTME，ImmuneSu...
-
TCGA轉(zhuǎn)錄組差異分析后多種基因功能富集分析：從GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID轉(zhuǎn)換）測序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
