在實踐之前，我先查找了一下有關組蛋白修飾的知識點：（參考文章：http://www.lxweimin.com/p/8aca72809c5c） 組蛋白修飾能預測染色質的類型（異...
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ChIP-seq實踐(H3K27Ac,enhancer的篩選和enhancer相關基因的GO分析) -
把顯著性添加給玩明白
1.編示例數據 到這一步，拿到了一個編的表達矩陣。 2.格式轉換 表達矩陣要畫ggplot2箱線圖，肯定是要先轉變格式的，否則ggplot2代碼無法下手寫。 3.畫箱線圖 [...
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linux下面安裝java
root下面安裝全局的JDK 以debian為例debian下載jdk：https://download.oracle.com/otn-pub/java/jdk/13.0.2...
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靚圖教程！論文圖片配色、線條及排版人都是視覺動物，喜歡漂亮的事物，看人的時候是這樣，看文章的時候也是這樣。有的文章排版疏朗，配圖雅致，看著就叫人心曠神怡。 論文配圖是醫學研究 SCI 的一個重要板塊，這也是文...
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R語言進行相關性分析相關性分析 相關性分析是指對兩個或多個具備相關性的變量元素進行分析，從而衡量兩個變量因素的相關密切程度。相關性分析旨在研究兩個或兩個以上隨機變量之間相互依存關系的方向和密切程...
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TCGA甲基化數據質量控制和差異分析（使用ChAMP包）參考文章：1.甲基化芯片入門學習-ChAMP包（二）2.TCGA數據庫的癌癥甲基化芯片數據重分析3.TCGA甲基化芯片數據質控和過濾4.甲基化芯片數據的差異分析5.甲基化芯片...
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limma 差異分析透徹講解基因表達差異分析是我們做轉錄組最關鍵根本的一步，edgeR+limma是目前最為推薦的方式。本文結合示例數據，將對這個過程進行梳理，讓你明白limma包的why，what，h...
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使用bedtools劃分各種條件的bin
參考染色體大小文件chrom.size 將染色體劃分為20bp為一個bin的區間 將染色體劃分成20bp為一個bin滑動距離為10bp的區間 將每條染色體劃分為5個相同大小的...
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聊UCSC xena的數據下載問題作者：白介素2 UCSC xena數據存儲中心總覽 UCSC xena的數據 存儲倉庫主要包括的數據有以下這些： TCGA hub Pan-Cancer Atlas Hub ...
