前言及背景 什么是基因組de?novo測序？其是對某一物種進行高通量測序，利用高性能計算平臺和生物信息學方法，在不依賴于參考基因組的情況下進行組裝，從而繪制該物種的全基因組序...
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IP屬地：四川
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一個高雜合真菌基因組組裝腳本（改代碼版）
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基因組組裝----SPAdes(一)
關于基因組組裝的流程可以參考我的簡書:http://www.lxweimin.com/p/e02ecd537c83 前面介紹了SOAPdenovo2的使用，但是由于結果整體不...
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WGCNA構建共表達網絡一這次用的數據是幾百個小鼠性狀的數據。 一：安裝 打開Rstudio 二：運行 1.構建共表達網絡 2.尋找最佳 β 首先確定sftpowerEstimate = 6。還有ne...
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fastQC對RNA-seq質控
FastQC - A high throughput sequence QC analysis tool fastqc安裝 1. 下載fastqc安裝包（http://www...
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（1）ATAC-seq和RNA-seq聯合分析——原始數據的獲取
前言 以這篇文章 Chromatin Accessibility-Based Characterization of the Gene Regulatory Network ...
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FastQC處理二代測序原始數據的質量結果解讀當二代測序的原始數據拿到手之后，第一步要做的就是看一看原始reads的質量。常用的工具就是fastqc (http://www.bioinformatics.babraham...
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自己構建物種包OrgDb，然后用clusterProfiler富集分析
利用clusterProfiler進行富集分析時，發現網上沒有物種包OrgDb，利用網上教程構建了一個。主要參考了劉小澤的簡書，特別感謝一下?。。?emapper首先得到注釋...
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2019年第48周：年度總結鍥子 去年是2018年第44周：策劃時開始著手年度總結的，相比之下，2019年晚了整一個月。最近幾日，心里也是頗不寧靜，尋尋覓覓的，好像一下子找不到存在的價值了。在今年元旦的...
