通過前期的分析,我們確定了感興趣的module,但是module中又含有幾十甚至上百的基因,下一步需要進一步篩選hub gene。 WGCNA(3):基因模塊與性狀關聯識別重...

通過前期的分析,我們確定了感興趣的module,但是module中又含有幾十甚至上百的基因,下一步需要進一步篩選hub gene。 WGCNA(3):基因模塊與性狀關聯識別重...
本次分享的文獻是發表在Nature plant上的一篇文獻,題目是 "Genomes of early-diverging streptophyte algae shed l...
請問TSS region可以設置-2000 0嗎?
chipseeker包的一些參數上的理解關于tssRegion參數: 理解:1、TSS是: 轉錄時,mRNA鏈第一個核苷酸相對應DNA鏈上的堿基它的上游是promoter它的下游就是相應的基因 2、做注釋的時候,需...
劉小澤寫于19.1.20-21要進行GO或者KEGG富集分析,就需要知道每個基因對應什么樣的GO/KEGG分類,OrgDb就是存儲不同數據庫基因ID之間對應關系,以及基因與G...
Homolog是同源基因。 Orthologs,Orthologues 直系同源,是指不同物種之間的基因,起源于共同的祖先,基因功能可能一樣,但又因為進化的關系,使得功能有...
重建系統發育關系=分子數據建樹? 一提到phylogeny,我們的第一反應就是分子數據建樹。這種理解是片面的,但也反映了一些它的分類學的區別: 首先,分類學在根據charac...
主要從如何看圖、用圖與作圖三個方面來對箱線圖進行理解和總結。 1、看圖 如圖所示,箱線圖是將一組數據按照大小順序排列后進行繪制的,包含6個數據節點,分別表示出數據的上邊緣、上...